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atatTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCtt > 1:21939/1‑242 (MQ=255) atTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAAc > 1:849886/1‑133 (MQ=255) gttgGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTaa > 1:40019/1‑251 (MQ=255) gctaTCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAAttg < 1:443366/247‑3 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |