| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,429,233 | 2 bp→AC | intergenic (‑8220/+15012) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gln‑TTG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,429,233 | 0 | G | A | 100.0% | 140.0 / NA | 53 | intergenic (‑8220/+15013) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gln‑TTG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (24/29); total (24/29) | |||||||||||
| * | 1 | 1,429,234 | 0 | T | C | 100.0% | 153.2 / NA | 53 | intergenic (‑8221/+15012) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gln‑TTG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (24/29); total (24/29) | |||||||||||
GTTGAAAAAGCCTTTAAAAAATTAGGGCGCGAAATTAATTTATCGGTTCATTAAAAAATGCGGTCGATTTGACCGCACTTTAAGCTGTATAGCGTGCGGTCTGTTGTTGCCCGTAAATGTCTTGATAGTCAATTGAGATTGTCAGCTTGCGCGAATCGGGTTCAAAATCCGCCTGATAATCGGTAATTTTTGACACTCCTTCCGTTCCCAGTACATGCCGCTTTATTTTAATTTCCCAATCCGCCAGATTCACACCGCGCCCCATTTGTTCAAGCCACGGCAAGCCATGTTCCAGATCTAGAAACCAGTCATTGGCAAACGACCAAAGGCGGGTTTGTACATTCTGTGCGATAGCTTCAGATTCGGTGGCGTAGTTCGAAAAACCTTGCCCAAACGTCCAATCGTGATTTTTATCCAGCCGTCTTACTCTTGTTGTC > 1/1429023‑1429459 || gttgAAAAAGCCTTTAAAAAATTAGGGCGCGAAATTAATTTATCGGTTCATTAAAAAATGCGGTCGATTTGACCGCACTTTAAGCTGTATAGCGTGCGGTCTGTTGTTGCCCGTAAATGTCCTGATAATCAATGGATATTGTCAGTTTGCGCGAATCGGGTTCAAAATCAGCCTGATAGTCGGTGATTTTTGACACTCCTTCAGTCTCCAACACATGACGCTTAATTTTGATTTCCCAATCTGCCAGAttg > 1:236200/1‑250 (MQ=255) aaaaTTAGGGCGCGAAATTAATTTATCGGTTCATTAAAAAATGCGGTCGATTTGACCGCACTTTAAGCTGTATAGCGTGCGGTCTGTTGTTGCCCGTAAATGTCCTGATAATCAATGGATATTGTCAGTTTGCGCGAATCGGGTTCAAAATCAGCCTGATAGTCGGTGATTTTTGACACTCCTTCAGTCTCCAACACATGACGCTTAATTTTGATTTCCCAATCTGCCAGATTGACACCGCGCCCCATTTg < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |