| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,205,001 | 2 bp→AA | intergenic (+45421/+215935) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,205,001 | 0 | C | A | 100.0% | 208.7 / NA | 74 | intergenic (+45421/+215936) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (34/40); total (34/40) | |||||||||||
| * | 1 | 1,205,002 | 0 | G | A | 100.0% | 209.8 / NA | 74 | intergenic (+45422/+215935) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/40); total (34/40) | |||||||||||
CAAGAAGACGGTTCGATAGAACATATCGATTTTGCACAACATGCGCGCTTATGCGTTCAATCCGGCATTGCTCACCAGACTACTGCCGATAAACTCAATATTTATTTAATGGCGTGTGAATCCGGTAAAACAAAAAGCAGTATCGATTCAACCTTTATCAGTCCGTTAACCATTTTTCAAAATGAAATTGTTGAACACGCTACCTCTGCCAGTGATTTTGATTTACGCGCCTTGCGCCGGGAAAAAATCACGATTTATTTCCACATTTCGGCAAATGATTTAATCCTGGCTCCGCAAGTCGCTAATCTGTTTATGAGCATGGTTATTGCCAACAATATTGACGAACTACCGGAAACCAACCCAACATTAAAATATCAGTTATTACTACTCATGGATGAGTTTACTGCCGTCGGTATGTTGAGCATTATCAATAAATCGGTAGGGTTTATCGCCGGT > 1/1204764‑1205219 || cAAGAAGACGGTTCGATAGAACATATCGTTTTTGCACAACATGCGCGCTTATGCGTTCAATCCGGCATTGCTCACCAGACTACTGCCGATAAACTCAATATTTATTTAATGGCGTGCGAATCCGGTAAAACAAAAAACAGTATCGATTCAACCTTTATCAGTCCGCTAACCATTTTTCAAAATGAAATTGTTGAATTTGCGACTTCTGCCCGTGATTTTGTTTTACGCGCTTTACGCAAGGAAAAAATcc > 1:608590/1‑249 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CAAGAAGACGGTTCGATAGAACATATCGATTTTGCACAACATGCGCGCTTATGCGTTCAATCCGGCATTGCTCACCAGACTACTGCCGATAAACTCAATATTTATTTAATGGCGTGTGAATCCGGTAAAACAAAAAGCAGTATCGATTCAACCTTTATCAGTCCGTTAACCATTTTTCAAAATGAAATTGTTGAACACGCTACCTCTGCCAGTGATTTTGATTTACGCGCCTTGCGCCGGGAAAAAATCACGATTTATTTCCACATTTCGGCAAATGATTTAATCCTGGCTCCGCAAGTCGCTAATCTGTTTATGAGCATGGTTATTGCCAACAATATTGACGAACTACCGGAAACCAACCCAACATTAAAATATCAGTTATTACTACTCATGGATGAGTTTACTGCCGTCGGTATGTTGAGCATTATCAATAAATCGGTAGGGTTTATCGCCGGT > 1/1204764‑1205219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |