| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,201,746 | 2 bp→TT | intergenic (+42166/+219190) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,201,746 | 0 | A | T | 100.0% | 150.4 / NA | 56 | intergenic (+42166/+219191) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (32/24); total (32/24) | |||||||||||
| * | 1 | 1,201,747 | 0 | A | T | 100.0% | 152.2 / NA | 56 | intergenic (+42167/+219190) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (32/24); total (32/24) | |||||||||||
ACCATCACACCAAACTATGCTTATGATGACGGTATTTTTACTTATCTTGGATTTGCCCCAAATAAAACCTTTCCTGCAGCCTTCTTGTTAGAAGGCTCCACGGAAAGTCTGTTAAATACTAATGTTAAACAAGACGGTAATTATCAGGTATTAGTCATCCAAAAAACAGCAGAAAAATTGGTATTACGTAGCGGTGAAAAAGTGGTCGGCATTTACAATCAAAGTTACGGAAAAACACCGGTAACTTATAACACGACCATTTCACCAAATGTGGCAAGAGACGAACGATAGGAGGCAGAGATGAACGATAACAAAACCATTCAGCCGACGGATGACAAAACGGAAACCGATTATCAACCGGAAGTCAGCAAAATTGCCAAACGCGGTAAAAACCAAAATCTATTTATTTTTCTGATTATTGCACTGCTTGCCGTGGCGTTTTTGGGTTATTCCTTTTTGAATAAAAAGGATACGCAACCGG > 1/1201504‑1201984 || gtcaatctatgagtagcagttttgccagctcactttttacaattattggcatgacactgacaatttactttttaggaaaaggatttgccgtaatatctggcaaaattgaagctccagcaacagcattaatttatgattttgtcacaaaaatgattattgtggcatttatgatgaattatggggggtatctagataactctttatcgataattgatgatcttaaaactagttAAAACGCCGGTTTCTTATaa > 1:218607‑M2/232‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |