| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 859,137 | 2 bp→CA | intergenic (‑9480/‑63080) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 859,137 | 0 | A | C | 100.0% | 135.0 / NA | 47 | intergenic (‑9480/‑63081) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (20/27); total (20/27) | |||||||||||
| * | 1 | 859,138 | 0 | G | A | 100.0% | 124.3 / NA | 47 | intergenic (‑9481/‑63080) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (20/27); total (20/27) | |||||||||||
ACGTAATACACCTTGATTTCCATTGAATCCACCTCCGAAACCGAAGTTACCTCCGACTAATGGACCACTACCGGCAACGTGGCTCCAGTTAATGCCCATTGCCTCAGAAAGTTTTTTATTTACCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTATCGGCAATATTTGCGTTATCAACGACACCATCGTAATGATATTTGTCTAAGAATGGTAAAGAGTCTTCTCCTAATTTTGTTTCAGTAACCTTTCTACCACTTCCTAAAGCTTCTCCTACAATTCTGCGAACCTCATCGCTTTCTTCTTGAGAACGGGCTTTTCCCTCAATTACATAAGCCTTGCCTACTTTTTTTACAGATAGATTAGTATTTGGGAA > 1/858916‑859293 || aCGTAATACACCTTGATTTCCATTGAATCCACCTCCGAAACCGAAGTTACCTCCGACTAATGGACCACTACCGGCAACGTGACTCCAGTTAATACCCATCGCCTCAGAAAGTTTCTTATTTACCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAAc > 1:341443/1‑249 (MQ=255) cGTAATACACCTTGATTTCCATTGAATCCACCTCCGAAACCGAAGTTACCTCCGACTAATGGACCACTACCGGCAACGTGTCTCCAGTTAATACCCATCGCCTCAGAAAGTTTCTTATTTACCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCtt > 1:92207/1‑251 (MQ=255) 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ccAGTTAATACCCATCGCCTCAGAAAGTTTCTTATTTACCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCTTTCGACCGTTTCCTAAAGCTTCTCCTACAATTCTACGAACTTCATCGCTTTCTTCTTGTGAACGAGCTTTACCTTCAATTACAt < 1:17735/251‑1 (MQ=255) aGTTAATACCCATCGCCTCAGAAAGTTTCTTATTTACCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCTTTcgac < 1:175589/171‑4 (MQ=255) aGTTAATACCCATCGCCTCAGAAAGTTTCTTATTTACCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCTTTCGACCGTTTCCTAAAGCTTCTCCTACAATTCTACGa > 1:391127/1‑203 (MQ=255) aGTTAATACCCATCGCCTCAGAAAGTTTCTTATTTACCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCTTTCGACCGTTTCCTAAAGCTTCTCCTACAATTCTACGAACTTCATCGCTTTCTTCTTgtg < 1:40864/225‑3 (MQ=255) 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taCCTCTACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCTTTCGACCGTTTCCTAAAGCTTCTCCTACAATTCTACGAACTTCATCGCTTTCTTCTTGTGAACGAGCTTTACCTTCAATTACATAGGCCTTACCTACTTTCTTCACAGATAGATTAGTAt < 1:862888/251‑1 (MQ=255) ctctACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCTTTCGACCGTTTCCTAAAGCTTCTCCTACAATTCTACGAACTTCATCGCTTTCTTCTTGTGAACGAGCTTTACCTTCAATTACATAGGCCTTACCTACTTTCTTCACAGATAGATTAGTATTTg > 1:251446/1‑251 (MQ=255) ctACAACAGAAAGCTTCACATTAATTTGGGTTGTGTCTGCAATATTTGCGTTATCAACAACACCATCGTAATGGTATTTGTCTAAGAACGGCAAAGCATCTTCCCCTAACTTTGTTTCAGTAACCTTTCGACCGTTTCCTAAAGCTTCTCCTACAATTCTACGAACTTCATCGCTttcttc < 1:361749/181‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |