| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 856,762 | 2 bp→CA | intergenic (‑7105/‑65455) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 856,762 | 0 | T | C | 100.0% | 47.4 / NA | 18 | intergenic (‑7105/‑65456) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (11/7); total (11/7) | |||||||||||
| * | 1 | 856,763 | 0 | G | A | 100.0% | 42.0 / NA | 18 | intergenic (‑7106/‑65455) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (11/7); total (11/7) | |||||||||||
TCTTTTCAATATCAAGATTACTTAGTACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAGCCACTATTTACTGTTTAATGAGTTTTGAAAAAAATGAAGAAAATAAACTCTGTTTTTCTTTCGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAATGAATTAATTTCCTTTTTACCATCACGACCTAAGTTAATACCTAATATGGTTTTTGTATTAGTGTTTTTAATATACGGGATTACGGCATCTATTGAAGAACCAATTAAAGTTTCTATATCATTTTTGGCCATTAACTTAGCTGATTCCATTCGATTATCAGAAATACAGACAAAAGTACGAATTGGTTTTCTCGAAGTGCCACGGAT > 1/856536‑856921 || tCTTTTCAACATCAAGATTGCTCAATACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATGCCCAATACAGTTTTTGTATTAGTATTTTTaac < 1:106686/251‑2 (MQ=255) gctcaatACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATGCCCAATACAGTTTTTGTATTAGTATTTTTaac > 1:476089/7‑231 (MQ=255) acttcacttcTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGCTAATGCCCAATACAGTTTTTGTATTAGTATTTTTAACAAAAGGAATTATGGCATCTATTgaag < 1:577410/251‑1 (MQ=255) tcacttcTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATGCCCAATACAGTTTTTGTATTAGTATTTTTAACAAAAGGAATTATGGCATCTATTGAAGAAc < 1:44448/251‑1 (MQ=255) gATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATGCCCAATACAGTTTTTGTATTAGTATTTTTAACAAAAGGAATTATGGCATCTATTGAAGAAc > 1:402244/1‑237 (MQ=255) 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atatTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATGCCCAATACAGTTTTTGTATTAGTATTTTTAACAAAAGGAATTATGGCATCTATTGAAGAACCGATTaagg > 1:393820/1‑136 (MQ=255) atatTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATGCCCAATACAGTTTTTGTATTAGTATTTTTAACAAAAGGAATTATGGCATCTATTGAAGAACCGATTAAGGTTTCGATATCATTCTTAGCCATTAACTTAGCTGCTTCTAACCGATTATCAGAAATACat > 1:19406/1‑196 (MQ=255) || TCTTTTCAATATCAAGATTACTTAGTACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAGCCACTATTTACTGTTTAATGAGTTTTGAAAAAAATGAAGAAAATAAACTCTGTTTTTCTTTCGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAATGAATTAATTTCCTTTTTACCATCACGACCTAAGTTAATACCTAATATGGTTTTTGTATTAGTGTTTTTAATATACGGGATTACGGCATCTATTGAAGAACCAATTAAAGTTTCTATATCATTTTTGGCCATTAACTTAGCTGATTCCATTCGATTATCAGAAATACAGACAAAAGTACGAATTGGTTTTCTCGAAGTGCCACGGAT > 1/856536‑856921 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |