| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 791,036 | T→C | intergenic (+53914/+29257) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 791,036 | 0 | T | C | 100.0% | 150.3 / NA | 55 | intergenic (+53914/+29257) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (23/32); total (23/32) | |||||||||||
GAAAATCCCTGCAAGCGTTCGGCAAATAACGCCAGACAATTTACCCCGCGTTCAATTGCTGCCTGGCTTAACACTTGGTTTTCATCCAAGCCTTCCGCAAGCTGGACTTTCTGCTTCAACCGCGATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTTGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGACCACTACTTTAGATCTGTCGCCCACCCCGGCGGTACTCAGGTT > 1/790801‑791278 | gAAAATCCCTGCAAGCGTTCGGCAAATAACGCCAGACAATTTACCCCGCGTTCAATTGCTGCCTGGCTTAACACTTGGTTTTCATCCAAGCCTTCCGCAAGCTGGACTTTCTGCTTCAACCGCGATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAg > 1:22966/1‑251 (MQ=255) cTGCAAGCGTTCGGCAAATAACGCCAGACAATTTACCCCGCGTTCAATTGCTGCCTGGCTTAACACTTGGTTTTCATCCAAGCCTTCCGCAAGCTGGACTTTCTGCTTCAACCGCGATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAAtttt > 1:518992/1‑251 (MQ=255) ttCGGCAAATAACGCCAGACAATTTACCCCGCGTTCAATTGCTGCCTGGCTTAACACTTGGTTTTCATCCAAGCCTTCCGCAAGCTGGACTTTCTGCTTCAACCGCGATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTc < 1:593186/250‑1 (MQ=255) cGCCAGACAATTTACCCCGCGTTCAATTGCTGCCTGGCTTAACACTTGGTTTTCATCCAAGCCTTCCGCAAGCTGGACTTTCTGCTTCAACCGCGATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAAtt > 1:101872/1‑250 (MQ=255) 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ccGCAAGCTGGACTTTCTGCTTCAACCGCGATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCa < 1:633641/251‑1 (MQ=255) cgATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAgg > 1:137281/1‑181 (MQ=255) cgATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCt > 1:612809/1‑183 (MQ=255) cgATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGc < 1:673787/251‑1 (MQ=255) ataCCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAAc < 1:892259/251‑1 (MQ=255) taCCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAac < 1:300721/185‑1 (MQ=255) ccTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAGAGGCTTGATTAacac > 1:455968/1‑185 (MQ=255) ccTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGt > 1:286985/1‑251 (MQ=255) 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cTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGc < 1:322434/222‑1 (MQ=255) tGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATgg < 1:222203/251‑1 (MQ=255) tGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATgg < 1:376152/251‑1 (MQ=255) gAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGtt < 1:570697/59‑1 (MQ=255) 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aaGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGAc > 1:279680/1‑250 (MQ=255) gcgATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCTAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGACCACTACTTTAGa < 1:482997/250‑1 (MQ=255) cgATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGACCACTACTTTAGATc < 1:27136/251‑1 (MQ=255) 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ccTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGACCACTACTTTAGAt < 1:86982/238‑1 (MQ=255) ccTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGACCACTACTTTAGATCTGTCGCCCAcc > 1:191791/1‑250 (MQ=255) tCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTCGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGACCACTACTTTAGATc > 1:706841/1‑237 (MQ=255) 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GAAAATCCCTGCAAGCGTTCGGCAAATAACGCCAGACAATTTACCCCGCGTTCAATTGCTGCCTGGCTTAACACTTGGTTTTCATCCAAGCCTTCCGCAAGCTGGACTTTCTGCTTCAACCGCGATAATACCTGTAACGTGCCGTTGACGATGCGGGCGATGATCATGTGAAAGCTGTTGGAACCTAAGTCGATCGCGGCGATTTCACGCACCTCGCCACGTCGGGCGTAGAGTTTGTTAGCTTTCTTTAGTAAATTTTCGTTATTCATAATTAAAATTCAAATTGATAGAGTAGATCAAAGGCTTGATTAACACCCGAAACGGATTGAACATACAGTTGTGGCAATAATCGGTAACGCAGAGTCACTTCGGCTAAACCGTCAAATAACCCAACGCCGTATTTTACCTGTAAGCGCGGTGTAATGGTGCCGCTGACCACTACTTTAGATCTGTCGCCCACCCCGGCGGTACTCAGGTT > 1/790801‑791278 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |