| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 755,630 | T→C | intergenic (+18508/+64663) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 755,630 | 0 | T | C | 98.8% | 218.5 / ‑4.9 | 82 | intergenic (+18508/+64663) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (36/45); total (36/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
AATGAAATACGTTGACGGTGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACTGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGCGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAATCCAGCGGGAAACCATAAGTATCATATAA > 1/755382‑755875 | aaTGAAATACGTTGACGGCGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACTgg < 1:861681/251‑1 (MQ=255) cggcgAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGaa > 1:531807/5‑251 (MQ=255) cgAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAg < 1:722151/250‑1 (MQ=255) aaCCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTg < 1:847424/251‑1 (MQ=255) tCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTg < 1:900175/247‑1 (MQ=255) gTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGaaa < 1:568069/241‑1 (MQ=255) ccACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACtttt > 1:875137/1‑251 (MQ=255) cTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGcc < 1:673627/251‑1 (MQ=255) gCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAg > 1:453993/1‑251 (MQ=255) ttCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGt > 1:271175/1‑251 (MQ=255) ttCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGt > 1:293083/1‑251 (MQ=255) cGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGt < 1:43115/216‑1 (MQ=255) aCGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGtat < 1:781247/250‑1 (MQ=255) cGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAg > 1:746899/1‑251 (MQ=255) gATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGACAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGc > 1:313850/1‑250 (MQ=255) aTAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGcc < 1:375287/250‑1 (MQ=255) aCCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGTCCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGaa > 1:73164/1‑201 (MQ=255) aCCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCaaaa > 1:375148/1‑250 (MQ=255) gggTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGtt > 1:895834/1‑251 (MQ=255) gTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCt < 1:103069/233‑1 (MQ=255) gTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCaaa > 1:364550/1‑238 (MQ=255) gTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGcc > 1:172099/1‑250 (MQ=255) ccGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGc < 1:712525/226‑1 (MQ=255) ccGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCaa > 1:33387/1‑250 (MQ=255) atatGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACg > 1:150439/1‑251 (MQ=255) acccaattcccTGA‑CATATTTTTGGGTGTCTTTTTAC‑TCAAAAATAAAAACCTTTGCC‑TCCAAGCGGCCGATGTTTCCGGTTTGGCCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATaa < 1:382183/242‑1 (MQ=255) aCCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGttc > 1:522768/1‑164 (MQ=255) aaTACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACAtt > 1:323905/1‑251 (MQ=255) aaTACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACAt < 1:632788/250‑1 (MQ=255) aTACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACAt < 1:467380/249‑1 (MQ=255) tACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGtat > 1:499665/1‑209 (MQ=255) ccTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTGCGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCAATTTGTCCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCAGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTta < 1:170916/251‑1 (MQ=255) cTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTtat < 1:113059/251‑1 (MQ=255) aCCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGtat < 1:734123/203‑1 (MQ=255) ccATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCt > 1:237106/1‑207 (MQ=255) ccATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc < 1:240866/251‑1 (MQ=255) ccATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc < 1:849861/251‑1 (MQ=255) ccATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc < 1:514656/251‑1 (MQ=255) ccATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc < 1:831639/251‑1 (MQ=255) cATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATcc < 1:831813/251‑1 (MQ=255) cATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATcc < 1:267182/251‑1 (MQ=255) atTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATaa < 1:42362/234‑1 (MQ=255) atTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATcc < 1:612528/248‑1 (MQ=255) tttttGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATa > 1:804695/1‑250 (MQ=255) tttttGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATAc < 1:631887/251‑1 (MQ=255) tC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTg < 1:846045/251‑1 (MQ=255) aaTTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGc > 1:142694/1‑177 (MQ=255) aaTTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc < 1:189064/223‑1 (MQ=255) aaTTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGACGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCgg < 1:781103/243‑1 (MQ=255) aTTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGtat < 1:72194/173‑1 (MQ=255) aTTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTgtgcg > 1:153863/1‑250 (MQ=255) aTTAAAACCGTCGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGtt > 1:40122/1‑190 (MQ=255) aCCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCTGATTTGACCACCGGATGCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc < 1:423045/216‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGtt > 1:531508/1‑251 (MQ=255) cTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAAc < 1:559027/193‑1 (MQ=255) cccGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTcg > 1:247504/1‑250 (MQ=255) tctcCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCaaa > 1:428433/1‑251 (MQ=255) ggATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTtat < 1:297842/170‑1 (MQ=255) aTTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTa > 1:88646/1‑251 (MQ=255) aTTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTa > 1:281102/1‑251 (MQ=255) cGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGc < 1:605210/251‑1 (MQ=255) gCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACttt < 1:163778/95‑1 (MQ=255) gCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGAttt > 1:692535/1‑210 (MQ=255) cATAGAAGGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCATTTTGACCGGAACTGATGGTATCTCCCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCcg < 1:701500/251‑1 (MQ=255) gAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc > 1:708184/1‑162 (MQ=255) gAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATc < 1:23789/162‑1 (MQ=255) ggCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTAGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACg > 1:455429/1‑251 (MQ=255) aaaaTCACCCCCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTCCCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGc < 1:791918/251‑1 (MQ=255) aaaaTCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGc < 1:646950/251‑1 (MQ=255) aaaTCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACAt < 1:197592/135‑1 (MQ=255) accGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAAt > 1:870859/1‑250 (MQ=255) ccGCACTTTGCCCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTGGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACGGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAATcc < 1:217736/251‑1 (MQ=255) ccGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATcc > 1:774682/1‑199 (MQ=255) ccGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACa > 1:568717/1‑236 (MQ=255) gACCGGAACTGATGGTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAAc > 1:658917/1‑90 (MQ=255) ggTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAATCCAGCGGGAAAcc > 1:614055/1‑240 (MQ=255) ggTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAATCCAGCGGGAAACCGTAAGTATCat > 1:338562/1‑251 (MQ=255) gTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCcg < 1:256524/198‑1 (MQ=255) gTATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGGGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGc < 1:512645/196‑1 (MQ=255) tATCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATCCCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAATCCAGCGGGAAACCGTAAGTATCatat < 1:139083/251‑1 (MQ=255) aTCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGc < 1:138155/194‑1 (MQ=255) tCTACCGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCCCTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGTGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAATCCAGCGGGAAACCGTAAGTATCATATaa < 1:693512/251‑1 (MQ=255) | AATGAAATACGTTGACGGTGAACCTCGTCAACCACTGCATTCACGGACTGCCCGACGGATAAACTACCTTGGGTAAGTTCACCGATATGACCGAATACCTGACCATATTTTTGGGTGTC‑TTTTACGTC‑AAAATTAAAACCGTTGCCTTCTAAGCGCCCGATGTCTCCGATTTGACCACCGGATTCCGCATAGAATGGCGTATTATCTAAAATCACCACCGCACTTTGACCGGAACTGATGGTATCTACTGGTTTGCCGTCATGGAAAAGTGCGGTCACTTTTGCCAGCGTTTCCGATTCAGTATAGCCTTCAAAACGGGTTATGCCATCAACACGAATAACATTGTTATAATCCATACCGAATTGGCTGGCGGACTGCGCGCGCAAACGTTGATTTTCCATCTCGCGTTCAAATCCCGCCTCATCGATGGTAATGCCGCGTTCACGACAAACATCGGCAGTTAAATCCAGCGGGAAACCATAAGTATCATATAA > 1/755382‑755875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |