| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 753,979 | T→C | intergenic (+16857/+66314) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 753,979 | 0 | T | C | 100.0% | 218.6 / NA | 80 | intergenic (+16857/+66314) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Thr‑GGT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (39/41); total (39/41) | |||||||||||
AACCCGGTATCCGCGCTAATCGGACGGGACCCTTCAGGCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGATAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATACGTTGGTAAATTTCTTCTCTATGAATAGAAACATCCT > 1/753735‑754204 | aaCCCGGTATCCGCGCTAATCGGACGGGACCCTTCACGCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGt > 1:40776/1‑251 (MQ=255) cGGTATCCGCGCTAATCGGACGGGACCCTTCACGCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTg < 1:270080/251‑1 (MQ=255) ggTATCCGCGCTAATCGGACGGGACCCTTCACGCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTgg > 1:581492/1‑251 (MQ=255) aaTCGGACGGGACCCTTCACGCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGc > 1:608917/1‑241 (MQ=255) ggACGGGACCCTTCACGCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGcc > 1:63538/1‑250 (MQ=255) tcacgCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGAcc < 1:325086/247‑1 (MQ=255) tcacgCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGAcc < 1:789648/247‑1 (MQ=255) aaTTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCg < 1:509541/248‑1 (MQ=255) ttttAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGAcc > 1:801549/1‑240 (MQ=255) ttttAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATaaa > 1:440616/1‑251 (MQ=255) ccGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAatat > 1:848434/1‑250 (MQ=255) cGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAAc < 1:740817/244‑1 (MQ=255) gTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAatat > 1:481872/1‑248 (MQ=255) ttGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCtg > 1:326867/1‑250 (MQ=255) ccATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAat < 1:483689/238‑1 (MQ=255) ccATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAAt > 1:893344/1‑251 (MQ=255) ggCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAg > 1:111697/1‑251 (MQ=255) cTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCg < 1:31051/251‑1 (MQ=255) cTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTCTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGc < 1:705817/250‑1 (MQ=255) cTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAatat > 1:284230/1‑216 (MQ=255) cTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAAt < 1:385582/227‑1 (MQ=255) cTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGata < 1:568561/251‑1 (MQ=255) cTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGata > 1:154801/1‑251 (MQ=255) cTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGata > 1:705752/1‑251 (MQ=255) cTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGata > 1:707060/1‑251 (MQ=255) cTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTAGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGata > 1:454267/1‑251 (MQ=255) cAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCtg < 1:133091/216‑1 (MQ=255) ccaccGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGc < 1:354223/251‑1 (MQ=255) ccaccGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAAACAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGc < 1:607672/251‑1 (MQ=255) caccGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCt < 1:649025/251‑1 (MQ=255) ttttCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGc < 1:778116/249‑1 (MQ=255) tAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCg > 1:646817/1‑172 (MQ=255) cAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAAt < 1:574139/250‑1 (MQ=255) aaTAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATtc > 1:565486/1‑190 (MQ=255) gACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCAt > 1:888556/1‑250 (MQ=255) aCTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCAt < 1:105585/249‑1 (MQ=255) ctGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGa < 1:338185/251‑1 (MQ=255) ctGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGa < 1:61699/251‑1 (MQ=255) gTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCg < 1:836696/112‑1 (MQ=255) gTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAAt < 1:571515/174‑1 (MQ=255) gTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGAt > 1:114599/1‑250 (MQ=255) tCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATc < 1:428262/250‑1 (MQ=255) gTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGa < 1:250797/147‑1 (MQ=255) tttCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAAt < 1:627579/251‑1 (MQ=255) aCCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGt < 1:224117/216‑1 (MQ=255) cAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCttt > 1:734901/1‑251 (MQ=255) cATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGAcc > 1:648584/1‑121 (MQ=255) cATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAatat > 1:313325/1‑138 (MQ=255) cATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCAcc > 1:354582/1‑213 (MQ=255) cATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGa > 1:758093/1‑224 (MQ=255) cATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGt < 1:713129/249‑1 (MQ=255) tAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAAc > 1:454448/1‑101 (MQ=255) cacCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATcc > 1:801347/1‑249 (MQ=255) cacCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATca > 1:534929/1‑248 (MQ=255) ccTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAg > 1:837827/1‑180 (MQ=255) tGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCcttgct < 1:631963/251‑1 (MQ=255) aTCCAATAATCCATTTTTTACCTCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCTAACATCTCCACCAACGACAATCTTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATTCATTACCTATGCGATAAACAATATCTGTTTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCATTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTTCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTtga > 1:854993/1‑251 (MQ=255) aTCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGAc < 1:576302/107‑1 (MQ=255) ccAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGc < 1:492741/166‑1 (MQ=255) ccAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAAt < 1:214616/218‑1 (MQ=255) cAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGc > 1:209153/1‑173 (MQ=255) cAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGc > 1:527718/1‑173 (MQ=255) cAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTtgatga > 1:75047/1‑251 (MQ=255) aatCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATAc < 1:452264/251‑1 (MQ=255) atCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGa > 1:514828/1‑143 (MQ=255) atCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAg > 1:145192/1‑159 (MQ=255) atCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAAt < 1:310549/187‑1 (MQ=255) atCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCcttgcttg < 1:675396/242‑1 (MQ=255) ttACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGt > 1:846380/1‑219 (MQ=255) ttACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATACGTTGGTAAAt < 1:767401/251‑1 (MQ=255) aCCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATACGTTGGTAAAttt < 1:117972/251‑1 (MQ=255) cTTTGTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGttt > 1:612767/1‑161 (MQ=255) ttttAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAg < 1:12402/140‑1 (MQ=255) ttttAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATACGTTGGTAAATTTCTTCTCTa > 1:434605/1‑251 (MQ=255) tAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATACGTTGGTAAATTTCTTCTCTATGa < 1:682699/251‑1 (MQ=255) ctctTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCa > 1:548606/1‑158 (MQ=255) tctTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATAc < 1:503391/224‑1 (MQ=255) ctTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGc < 1:171886/141‑1 (MQ=255) cGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGa < 1:206492/116‑1 (MQ=255) ttAAGCGAACATCGCCACCAACGACAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATACGTTGGTAAATTTCTTCTCTATGAATAGAAACATCCt < 1:50906/250‑1 (MQ=255) | AACCCGGTATCCGCGCTAATCGGACGGGACCCTTCAGGCACTAATTTTAAGCCGTTGTAGTCCATCGGGTTGTGGCTTGCGGTCACTTCAATACCACCGTCAGTTTTCAAAAATGATGTAGCAAAATAGACTTCCTCTGTCCCCGTTTCACCTAAATCAATTACATTAACACCTGAATCCAATAATCCATTTGTTACCGCACTTTTTAACTCTTTACTCGTTAAGCGAACATCGCCACCAACGATAATCGTTTTGGGCGTTAAAAACTGCCCGAATGCATGACCTATGCGATAAACAATATCTGTGTTTAATTCATCACCCAAGCGACCACGGATATCATAAGCTTTAAAGCAAGTCAGTTTAGTCATAATTCACCATCTTCATTGATCATAAAATTTGCTACGCTTTCTGTTCATCCCTTGCTTGATGAATACGTTGGTAAATTTCTTCTCTATGAATAGAAACATCCT > 1/753735‑754204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |