| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 717,017 | G→A | intergenic (+1749/‑19950) | unknown → / → unknown | tRNA‑Arg‑TCT/tRNA‑Phe‑GAA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 717,017 | 0 | G | A | 100.0% | 272.4 / NA | 95 | intergenic (+1749/‑19950) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑TCT/tRNA‑Phe‑GAA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (53/42); total (53/42) | |||||||||||
TCATCAGGGCGCGTTCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCATATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGGACAGAATTTTACTTAACATTTCCACGTTATTCAGTTCAATTTGCATATCAATATTCGCCACTTGGCGCTTGCTGTCCGTGTGAGTGGAAACGCCGAGTACGCTGATTTTTTCATTTGCCAGCACGGTGGTGATGTCGCGCAATAAGCCGTTGCGATCCGACGCCACGATGCGGATGTTGAGATAGAAGCCGCTGGAATAATTGTCGCCCCAGCGGGATTCCACCACGCGTTCCGGGTGTGCGG > 1/716772‑717260 | tcatcaGGGCGCGTTCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCATATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGAACAGa > 1:21386/1‑251 (MQ=255) atcaGGGCGCGTTCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCATATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGAACAGAAt < 1:402552/251‑1 (MQ=255) cgcgTTCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCATATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGAACAGAATTTTACtt < 1:679394/251‑1 (MQ=255) ttCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCATATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGAACAGAATTTTACTTAACa > 1:655900/1‑251 (MQ=255) ttCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCATATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGAACAGAATTTTACTTAACa > 1:813748/1‑251 (MQ=255) tCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCACATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGAACAGAATTTTACTTAACAt < 1:447083/251‑1 (MQ=255) gCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATGAAAATGCAGCAAAAAAGCTCGTGGCGAAAAGCGGTTTCATATTTGACCGCACTTTTTAAGCCTTTCATCGAATATTGGGTAGATTTAATTAAGTGGGTCAGTCCCGTGGTTTTATCCATTTGATTTTCCTTTTTTTCTTTTTATTAGAGGCGTTTGGCTTCAATGACATCATCCAGTTTTTCCAAACGGAACAGAATTTTACTTAACATTTCCa < 1:7134/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |