| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 709,527 | C→T | intergenic (+5238/‑5555) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 709,527 | 0 | C | T | 100.0% | 209.6 / NA | 78 | intergenic (+5238/‑5555) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (42/36); total (42/36) | |||||||||||
GCATCAAATCGCTGCGCCTTGATGTCATTCACGAGACGTTGAAACGCCGCTTTATCCCCCTTCGGCACGTCAATGATGACCTCATCTAAATAAGGGCAGGCGCGGGCGATTTCCGCCGTATACGTCGGCACAAGTGCGGTAAGTTTTAGCGACGGATCCGATGCTTTCAACATGGCAAACGCCGGCCATGCCAACATAAAATCACCCAGTTTATCGTTACGAATAACCAATACTTTTTTCATCGTCTGTTGTTCCTATCCAAGGTTTCGGCTTAAGGTCCGCCGGAAAAAATTTTGCTTATTCTAGCCCGACCATCGTCCATTAAAAAGCGACAAATAAAAAATCAGCGCCCTAATCCGTTAAGACGCTGATTTTGACTAAAATAAACAAGTTAGTTTTTTGACACTTTATTGGTCGCTTTGTTCACTTATTTAATTTCGCTTTGTAAGTCGGGTTCATCAAGTTTTCCACGGACAGAATATCAT > 1/709285‑709769 | gCATCAAATCGCTGCGCCTTGATGTCATTCACGAGACGTTGAAACGCCGCTTTATCCCCCTTCGGCACGTCAATGATGACCTCATCTAAATAAGGGCAGGCGCGGGCGATTTCCGCCGTATACGTCGGCACAAGTGCGGTAAGTTTTAGCGACGGATCCGATGCTTTCACCATGGCAAACGCCGGCCATGCCAACATAAAATCACCCAGTTTATCGTTACGAATAACCAATACTTTTTTCATTGTCtgttg > 1:424041/1‑251 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1:664208/250‑1 (MQ=255) tttttCATTGTCTGTTGTTCCTATCCAAGGTTTCGGCTTAAGGTCCGCCGGAAAAAATTTTGCTTATTCTAGCCCGACCATCGTCCATTAAAAAGCGACAAATAAAAAATCAGCGCCCTAATCCGTTAAGACGCTGATTTTGACTAAAATAAACAAGTTAGTTTTTTGACACTTTATTGGTCGCTTTGTTCACTTATTTAATTTCGCTTTGTAAGTCGGGTTCATCAAGTTTTCCACGGACAGAATatcat < 1:84117/251‑1 (MQ=255) ttttCATTGTCTGTTGTTCCTATCCAAGGTTTCGGCTTAAGGTCCGCCGGAAAAAATTTTGCTTATTCTAGCCCGACCATCGTCCATTAAAAAGCGACAAATAAAAAATCAGCGCCCTAATCCGTTAAGACGCTGATTTTGACTAAAATAAACAAGTTAGTTTTTTGACACTTTATTGGTCGCTTTGTTCACTTAttt > 1:826125/1‑198 (MQ=255) | GCATCAAATCGCTGCGCCTTGATGTCATTCACGAGACGTTGAAACGCCGCTTTATCCCCCTTCGGCACGTCAATGATGACCTCATCTAAATAAGGGCAGGCGCGGGCGATTTCCGCCGTATACGTCGGCACAAGTGCGGTAAGTTTTAGCGACGGATCCGATGCTTTCAACATGGCAAACGCCGGCCATGCCAACATAAAATCACCCAGTTTATCGTTACGAATAACCAATACTTTTTTCATCGTCTGTTGTTCCTATCCAAGGTTTCGGCTTAAGGTCCGCCGGAAAAAATTTTGCTTATTCTAGCCCGACCATCGTCCATTAAAAAGCGACAAATAAAAAATCAGCGCCCTAATCCGTTAAGACGCTGATTTTGACTAAAATAAACAAGTTAGTTTTTTGACACTTTATTGGTCGCTTTGTTCACTTATTTAATTTCGCTTTGTAAGTCGGGTTCATCAAGTTTTCCACGGACAGAATATCAT > 1/709285‑709769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |