| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 708,394 | A→G | intergenic (+4105/‑6688) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 708,394 | 0 | A | G | 100.0% | 200.5 / NA | 71 | intergenic (+4105/‑6688) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (33/38); total (33/38) | |||||||||||
TTTGCTGTTGCTTTCCGATTCGAGTTCCGCACCTTGGACAGTATTGTCGCAAGGCGTTGCGTTACAAGGGCAATTCAGCGTCGGTTGGGCATCGTGCATTATCAGCCTGACGTGATGCCGACGTGGTTTCCGCTAAAGCTCAGGCCGGGGCTCCCACGGTAATGAATATTTTCGTTATCGCCCTTGTCCTCGGCTTAACCACCTATTTACCGGAAAAACCCACCGCACTTTATGTACGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAATCGGTTGCC > 1/708159‑708640 | tttGCTGTTGCTTTCCGATTCGAGTTCCGCACCTTGGACAGTATTGTCGCAAGGCGTTGCGTTACAAGGGCAATTCAGCGTCGGTTGGGCATCGTGCATTATCAGCCTGACGTGATGCCGACGTGGTTTCCGCTAAAGCTCAGGCCGGGGCTCCCACGGTAATGAATATTTTCGTTATCGCCCTTGTCCTCGGCTTAACCACCTATTTACCGGAAAAACCCACCGCACTTTATGTGCGTTTTGCCTACGc < 1:365344/250‑1 (MQ=255) 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< 1:210694/238‑1 (MQ=255) ggAAAAACCCACCGCACTTTATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCg > 1:692657/1‑250 (MQ=255) gAAAAACCCACCGCACTTTATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATc < 1:18225/127‑1 (MQ=255) ccGCACTTTATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTaa < 1:526720/251‑1 (MQ=255) cGCACTTTATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAAt < 1:833580/251‑1 (MQ=255) cACTTTATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATTGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAATc < 1:439474/250‑1 (MQ=255) cTTTATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAATCGGt > 1:67268/1‑251 (MQ=255) cTTTATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAATCGGt > 1:546811/1‑251 (MQ=255) ttATGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAATCGGTTg > 1:791689/1‑251 (MQ=255) aTGTGCGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAATCGGTTGcc < 1:841883/251‑1 (MQ=255) | TTTGCTGTTGCTTTCCGATTCGAGTTCCGCACCTTGGACAGTATTGTCGCAAGGCGTTGCGTTACAAGGGCAATTCAGCGTCGGTTGGGCATCGTGCATTATCAGCCTGACGTGATGCCGACGTGGTTTCCGCTAAAGCTCAGGCCGGGGCTCCCACGGTAATGAATATTTTCGTTATCGCCCTTGTCCTCGGCTTAACCACCTATTTACCGGAAAAACCCACCGCACTTTATGTACGTTTTGCCTACGCCGTTATCGGCATTTTGCTGTCTCGGCATTGGTACGCTGATGTTTGCATTCGGTATCGGTCGGGTGGTGCAATACACGCTGTTATTTATCAGCCGCGTGCCATACTTTAGTAATAAACCGAATCATCTTCGCTAGCTTTTCCTCGATTGAGATTTTGCTTAAATCCGTCTGGCTGGCTTTGTCGTTAGATGGGCAAAATGCCAGATGTTTCGCCTCATCATTAATCGGTTGCC > 1/708159‑708640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |