| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 691,513 | G→T | intergenic (+193960/‑7830) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 691,513 | 0 | G | T | 100.0% | 170.8 / NA | 65 | intergenic (+193960/‑7830) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (29/36); total (29/36) | |||||||||||
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cTACAGCGGAATAAAAACTAGTTAACTGTTAGATTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGCTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATAA‑GAATAAGGCGGACAACCCAAATTCAAGATATAGGAGGATAAGTCAAGGGTAAGTAAAGCCAATGACGATTCAAGTCTATcac < 1:898511/250‑1 (MQ=18) gCGGAATAAAAACTAGTTAACTGTTAGATTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGCTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATAA‑GAATAAGGCTGACAACCCAAATTCAAGATATAGGAGGAt > 1:497472/1‑202 (MQ=18) gCGGAATAAAAACTAGTTAACTGTTAGATTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGCTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATAA‑GAATAAGGCTGACAACCCAAATTCAAGATATAGGAGGATAAGTCAATGGTAAGTAAAGCCAATGACGATTCAAGTCTATCACATACCa > 1:37683/1‑251 (MQ=255) aaaCTAGTTAACTGTTAGATTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGCTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATaag < 1:355476/155‑2 (MQ=255) aaCTAGTTAACTGTTAGATTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGCTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATAA‑GAATAAGGCTGACAACCCAAATTCAAGATATAGGAGGATAAGTCAATGGTAAGTAAAGCCAATGACGATTCAAGTCTATCACATACCAAATGGAACTg < 1:250955/251‑1 (MQ=255) cTGTTAGATTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGCTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATaag < 1:741486/144‑2 (MQ=255) tAGATTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAGCTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATAA‑GAATAAGGCTGACAACCCAAATTCAAGATATAGGAGGATAAGTCAATGGTAAGTAAAGCCAATGACGATTCAAGTCTATCACATACCAAATGGAACTGTAAGTATCACAtcg < 1:530057/251‑3 (MQ=14) | AAAGTAGATAGTGTGGCAAATCGCCGCCTAGCTTTTGCTCGTACACGCAACACAGAAACTGTTGCTAAATTATTTAATGAATTAGGTCCACGTTTTGCACAACGTGCTGGTGGCTACACCCGCATCCTTAAATGTGGTTTCCGTGCTGGCGATAATGCTCCAATGGCTTACATTGAGTTAGTAGATCGTCCAGAAGTTTCAAGTAAAGAAGCTACAGCGGAATAAAAACTAGTTAACTGTTAGAGTTAAAAAGGCTGAATAACATTTATTCAGCCTTTTTATTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAAACAAAACCGTACGCTATGCGTATGGAATCAAAGAACTTAAGCGGTCAACATAAAAAATCCTCACTATATAATGAATAAGGTTGACAACCAAAATTCAAGATATAGGAGGATAAGTCAATGGTAAGTAAAGCCAATGACGATTCAAGTCTATCACACACCAAATGGAACTGTAAGTACCACATTG > 1/691269‑691760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |