| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 675,014 | C→G | intergenic (+177461/‑24329) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 675,014 | 0 | C | G | 100.0% | 242.6 / NA | 85 | intergenic (+177461/‑24329) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (50/35); total (50/35) | |||||||||||
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aTCGGGTTATCGCTCAAGCCCAGAATTTTGTTGGTTTCTGCGTAACCTTTCCATTCTTCTTTGGTTTGACCGCTTTCCAATAATTTGTCGATCCAAGGAATCAGGCTGCCCGCCAACGGTGCGCCGAAGTTATCAATCGGGAAGTCTTTGTCGCGCATTTTGGCGGTCACGGCACGTTCAATGTCTAAAATGGAAGAATTCGGATCCGCAAGTAAGCCTTTCGCTTCGCCGTTTAACTCACCCATTTGCAc < 1:827860/251‑1 (MQ=255) aTCGGGTTATCGCTCAAGCCCAGAATTTTGTTGGTTTCTGCGTAACCTTTCCATTCTTCTTTGGTTTGACCGCTTTCCAATAATTTGTCGATCCAAGGAATCAGGCTGCCCGCCAACGGTGCGCCGAAGTTATCAATCGGGAAGTCTTTGTCGCGCATTTTGGCGGTCACGGCACGTTCAATGTCTAAAATGGAAGAATTCGGATCCGCAAGTAAGCCTTTCGCTTCGCCGTTTAACTCACCCATTTGCAc < 1:685253/251‑1 (MQ=255) gggTTATCGCTCAAGCCCAGAATTTTGTTGGTTTCTGCGTAACCTTTCCATTCTTCTTTGGTTTGACCGCTTTCCAATAATTTGTCGATCCAAGGAATCAGGCTGCCCGCCAACGGTGCGCCGAAGTTATCAATCGGGAAGTCTTTGTCGCGCATTTTGGCGGTCACGGCACGTTCAATGTCTAAAATGGAAGAATTCGGATCCGCAAGt > 1:607899/1‑210 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |