| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 667,532 | T→C | intergenic (+169979/‑31811) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 667,532 | 0 | T | C | 100.0% | 320.6 / NA | 110 | intergenic (+169979/‑31811) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (59/51); total (59/51) | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
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> 1:240132/1‑224 (MQ=255) gCATGTGGGTGGCAAACGAATGGCGCAATTTATGCGGATTTAAATGGCTGTTCAAACCTTGCCGAATGCCCCAGGTTTCCAAACGCATTTGGATTGCGCGGTGTGACATTCGGTTACCCAATTGGCTGACAAATAACGCATTGTCTTTCGGGTTAAATAACAACCGCACTTTCAGCCATTGCTGAATGGCGTGGGAGGCATAACGCCCGAATgg > 1:94170/1‑214 (MQ=255) gCATGTGGGTGGCAAACGAATGGCGCAATTTATGCGGATTTAAATGGCTGTTCAAACCTTGCCGAATGCCCCAGGTTTCCAAACGCATTTGGATTGCGCGGTGTGACATTCGGTTACCCAATTGGCTGACAAATAACGCATTGTCTTTCGGGTTAAATAACAACCGCACTTTCAGCCATTGCTGAATGGCGTGGGAGGCATAACGCCCGAATGGCACCACCCGTTcc > 1:199022/1‑227 (MQ=255) gCATGTGGGTGGCAAACGAATGGCGCAATTTATGCGGATTTAAATGGCTGTTCAAACCTTGCCGAATGCCCCAGGTTTCCAAACGCATTTGGATTGCGCGGTGTGACATTCGGTTACCCAATTGGCTGACAAATAACGCATTGTCTTTCGGGTTAAATAACAACCGCACTTTCAGCCATTGCTGAATGGCGTGGGAGGCATAACGCCCGAATGGCACCACCCGTTCCTTGtt > 1:668781/1‑232 (MQ=255) 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GTCGTAAAGGGTGTCGTCTAAATCAAAACTAATCACCTGAAAAGGCATTAAAGTGCGGTAGAATTTCATGGCGTTTTTTCCCTTATTTTTTACGTTTCGCGCGCGGGTGCGCGGCATCATACACCGCCGCCAAATGTTGGAAATTAAGGTGGGTATAAATTTGTGTGGTGGATAAATTGCTGTGTCCGAGCAGTTCTTGCACCGCGCGTAAATCGGAACTGGCTTCCAGCATGTGGGTGGCAAATGAATGGCGCAATTTATGCGGATTTAAATGGCTGTTCAAACCTTGCCGAATGCCCCAGGTTTCCAAACGCATTTGGATTGCGCGGTGTGACATTCGGTTACCCAATTGGCTGACAAATAACGCATTGTCTTTCGGGTTAAATAACAACCGCACTTTCAGCCATTGCTGAATGGCGTGGGAGGCATAACGCCCGAATGGCACCACCCGTTCCTTGTTACCTTTCCCGATAACCCGCACTTCACGCGA > 1/667288‑667777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |