| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 642,248 | C→T | intergenic (+144695/‑57095) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 642,248 | 0 | C | T | 100.0% | 282.5 / NA | 98 | intergenic (+144695/‑57095) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (49/49); total (49/49) | |||||||||||
ACCTTGTTCTCTGCCGGTTTAATCGTAGGCGAAAGCTTGATGGGCGTGGTATTAGCCTTCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTCTTTGTTCTCGGCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGCTACCTCCGGTAGCCTATTTTTTTACTCGGGAACCCTATGTCGCCTAATTATCCTTATATTAAAACATTGGTTATATTTCCTCTGCTTGCTCAACTTATCGGCACCATCGTCAGCATTTGTGTGGATGACAATACTGATGGTTTGCTCGGCACTGCCGACGTGATCCTTTTTAGTCTGTTATCGACTTTTATCGTGGCAACCGTGCCCGCTTTTTTGATTGCACTGTGGACAAAAATTTAT > 1/642002‑642485 | aCCTTGTTCTCTGCCGGTTTAATCGTAGGCGAAAGCTTGATGGGCGTGGTATTAGCCTTCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTCTTTGTTCTCGGCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGTTATCTcc < 1:147256/251‑1 (MQ=255) 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tctcTGCCGGTTTAATCGTAGGCGAAAGCTTGATGGGCGTGGTATTAGCCTTCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTCTTTGTTCTCGGCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGTTATCTCCGGTAGcc < 1:450400/251‑1 (MQ=255) tctcTGCCGGTTTAATCGTAGGCGAAAGCTTGATGGGCGTGGTATTAGCCTTCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTCTTTGTTCTCGGCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGTTATCTCCGGTAGcc < 1:442090/251‑1 (MQ=255) gTTTAATCGTAGGCGAAAGCTTGATGGGCGTGGTATTAGCCTTCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTCTTTGTTCTCGGCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGTTATCTCCGGTAGCCTAttttttt > 1:598955/1‑251 (MQ=255) 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cTTCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTCTTTGTTCTCGGCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGTTATCTCCGGTAGCCTATTTTTTTACTCGGGAACCCTATGTCGCCTAATTATCCTTATATTaaa > 1:291992/1‑251 (MQ=255) ttCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTC‑TTGTTCTCGTCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGTTATCTCCGGTAGCCTATTTTTTTACTCGGGAACCCTATGTCGCCTAATTATCCTTATATTAAAAc < 1:124406/251‑1 (MQ=255) tCATTATTGCGGCATCCGTGACCTCCGGCGGTTCTGAAGCGCCATTGGCGTTGAATCTGGAAAATTGGGACACCATCGCCGAGGTGCTGGGTTTAATCGTCTTTGTTCTCGGCATCGTGATTTTCACCTCTCGCGTATTACGTGCAAAAAAATCTGCATAAGCTGAAAAATTCCTCTACAATGGGTTATCTCCGGTAGCCTATTTTTTTACTCGGGAACCCTATGTCGCCTAATTATCCTTATATTAAAAc < 1:397688/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |