| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 639,931 | G→C | intergenic (+142378/‑59412) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 639,931 | 0 | G | C | 100.0% | 188.9 / NA | 66 | intergenic (+142378/‑59412) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (24/42); total (24/42) | |||||||||||
TATTAGATACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAAGTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAATATATTAAAAAATACGATATAAATTTAAATAAAATTCAATTTAAGTAAAATAAACTGAATGAATCTTG > 1/639686‑640148 | tATTAGATACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTatat < 1:461530/251‑1 (MQ=255) aTACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCTCCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGat < 1:394054/250‑1 (MQ=255) aTACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGat < 1:117819/250‑1 (MQ=255) aTACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGat < 1:778054/250‑1 (MQ=255) aTACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGat < 1:132817/250‑1 (MQ=255) aTACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGat < 1:801857/250‑1 (MQ=255) aTACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGat < 1:306985/250‑1 (MQ=255) tACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGatat < 1:726110/251‑1 (MQ=255) tACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGatat < 1:438515/251‑1 (MQ=255) cAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATAttt < 1:844731/251‑1 (MQ=255) cAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATAttt > 1:420944/1‑251 (MQ=255) tGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGat < 1:526401/251‑1 (MQ=255) tGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGat < 1:67486/251‑1 (MQ=255) gcgcAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGata > 1:777118/1‑251 (MQ=255) gCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATaaataaat > 1:90001/1‑251 (MQ=255) gTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGa > 1:228134/1‑251 (MQ=255) cTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGata < 1:520312/248‑1 (MQ=255) cTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATg > 1:184148/1‑250 (MQ=255) tCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTc < 1:386973/251‑1 (MQ=255) cATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTatat < 1:617626/218‑1 (MQ=255) ttGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGa < 1:61647/251‑1 (MQ=255) aCTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTc < 1:139054/247‑1 (MQ=255) cTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTa > 1:814028/1‑250 (MQ=255) cTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTAc < 1:354880/251‑1 (MQ=255) cTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTAc < 1:674979/251‑1 (MQ=255) ttttAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTcc > 1:75815/1‑246 (MQ=255) ttAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTAt < 1:369791/251‑1 (MQ=255) caccaATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCgg > 1:863429/1‑200 (MQ=255) aTCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGat < 1:188684/197‑1 (MQ=255) aTCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTAc < 1:228590/237‑1 (MQ=255) tCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAAc < 1:869453/251‑1 (MQ=255) gACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCgg < 1:120778/190‑1 (MQ=255) gACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTa < 1:896859/197‑1 (MQ=255) ccATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGat < 1:216472/199‑1 (MQ=255) aCAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCgg < 1:229966/178‑1 (MQ=255) cAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATta > 1:376575/1‑251 (MQ=255) aaTGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGat < 1:83298/186‑1 (MQ=255) tGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAAc < 1:787472/251‑1 (MQ=255) gTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTatat > 1:556227/1‑161 (MQ=255) aTTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTatat > 1:58684/1‑154 (MQ=255) aaaTTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTatttattt > 1:842993/1‑251 (MQ=255) cATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGt < 1:393156/250‑1 (MQ=255) gTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAAc > 1:442981/1‑191 (MQ=255) gTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAAc > 1:107901/1‑212 (MQ=255) gTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACg < 1:684835/250‑1 (MQ=255) gTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACg < 1:104083/250‑1 (MQ=255) caaTTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGC‑ACCGatgcaacgccaattta > 1:654553/1‑236 (MQ=255) aTTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGaaa < 1:511106/251‑1 (MQ=255) tttAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGa < 1:708067/251‑1 (MQ=255) ttAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGAc < 1:753457/251‑1 (MQ=255) aGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTAt < 1:53421/162‑1 (MQ=255) gTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAAt > 1:527585/1‑251 (MQ=255) tAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAACTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAAtt < 1:312169/251‑1 (MQ=255) aatgCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAatatat < 1:405450/251‑1 (MQ=255) atgCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCg > 1:733630/1‑212 (MQ=255) cACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCAAGTAg < 1:814190/198‑1 (MQ=255) aTTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAATATATTAAAAAATACGATATAAATTtaaataa > 1:767161/1‑251 (MQ=255) tAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAatatat < 1:675651/215‑1 (MQ=255) gTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAATATATTaaaa > 1:496338/1‑217 (MQ=255) atACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGAt > 1:144602/1‑94 (MQ=255) atACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAATATATTAAAAAATACGatat > 1:760836/1‑220 (MQ=255) aaaCCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAAc < 1:888548/132‑1 (MQ=255) ccTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAATATATTAAAAAATACGATATAAATTTAAATAAAATTCAATTTAAGTAAAATAAACtgaa > 1:417973/1‑251 (MQ=255) gTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAATATATTAAAAAATACGATATAAATTTAAATAAAATTCAATTTAAGTAAAATAAACTGAATGAATCTTg > 1:340697/1‑251 (MQ=255) ccTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGAt > 1:552423/1‑69 (MQ=255) ggTGAACTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCgg < 1:519756/105‑1 (MQ=255) | TATTAGATACAAAATGCGCAATGCCGTCAGCTTCATATTGACAGACTTTTAAGCCACCAATCCAGACCATTACGATACAAATGGCAATGCGTACAAAATTAATAAATTGGCGTTGCATCGGTGCAACAATTTTAGCAAGTAATTCAATGAATGCATTCATTTTTAGCCTCACGGAAATTCATAATTAAGTGGATGATACGAAACCTTTAGCGGTTATTTACCTAAGTAGAATTAGGTTTGGTGAAGTATATCGGATATTTAAGATAAATAAATTGATATGCTCCAAGATTCCTTACTATTGATACTAAAACAGATGAACTTAAGATTATAACGATGTCCTGCGGCTATTTATTTTGCTACCGAGTAGACGCCAATGAAAGACTCGTAATTAGAAATATATTAAAAAATACGATATAAATTTAAATAAAATTCAATTTAAGTAAAATAAACTGAATGAATCTTG > 1/639686‑640148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |