| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 639,252 | A→T | intergenic (+141699/‑60091) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 639,252 | 0 | A | T | 100.0% | 274.9 / NA | 99 | intergenic (+141699/‑60091) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (50/49); total (50/49) | |||||||||||
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caccGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAACCATAATTCGGCGTTGGTAAATCACCGCCCAAATTAGGCACCCAGGTCTCCGGTGTGAAAATAAGGAACGACAAAGTGACGATGGACATTCCGAACGTGAGCAACCCGCCAAATAAGCCCAATGTCGGCGACCGGATGCCGGCTAAGGTtaataa < 1:223523/248‑1 (MQ=255) accGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAACCATAATTCGGCGTTGGTAAATCACCGCCCAAATTAGGCACCCAGGTCTCCGGTGTGAAAATAAGGAACGACAAAGTGACGATGGACATTCCGAACGTGAGCAACCCGCCAAATAAGCCCAATGTCGGCGACCGGATGCCGGCTAAGGTTAATaaa < 1:496076/249‑1 (MQ=255) | CCGCGTGACACAATGTGAAATTTGCCGATTAAATTGGGTTCCTGCTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCCTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAATAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGCCAGA‑TTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAGCCATCGATTAGCGCATTCGGCGGCAGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATAATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAACCATAATTCGGCGTTGGTAAATCACCACCCAAATTAGGCACCCAGGTTTCCGGTGTGAAAATAAGGAACGACAAGGTAACGATGGACATCCCGAACGTGAGCAACCCGCCAAATAAGCCCAATGTCGGCGACCAGATACCGGCTAAGGTTAATAAA > 1/639010‑639495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |