| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 639,108 | C→T | intergenic (+141555/‑60235) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 639,108 | 0 | C | T | 100.0% | 233.8 / NA | 86 | intergenic (+141555/‑60235) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (50/36); total (50/36) | |||||||||||
ATGTGAATGCGCCCTGCGTGGTTTCGGTAATCGGGCTTTCTGTTCCCGCGCCGTGATAAAGGCTATGTTCCTCACCATAAGGCAGGAAGATTACATCGCCCGGTTTTAGATGGCAGGTTTGATTTTTCAGCCGAATCTGACATTCGCCGCGTGACACAATGTGAAATTTGCCGATTAAATTGGGTTCCTGCTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCCTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAATAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGCCAGA‑TTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAGCCATCGATTAGCGCATTCGGCGGCAGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATAATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAACCATAATTCGGCGT > 1/638864‑639353 | aTGTAAATGCGCCCTGCGTGGTTTCGGTAATCGGGCTTTCTGTTCCCGCGCCGTGATAAAGGCTATGTTCCTCACCATAAGGCAGGAAGATCACATCGCCCGGTTTTAGATGGCAGGTTTGATTTTTCAGCCGAATCTGACATTCGCCGCGTGACACAATGTGAAATTTGCCGATTAAATTGGGTTCCTGCTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATg > 1:752905/1‑251 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1:332415/251‑1 (MQ=255) aaaTTGGGTTCCTGCTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCat < 1:253868/110‑1 (MQ=255) gCTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAg < 1:429616/92‑1 (MQ=255) gCTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCttt > 1:311868/1‑251 (MQ=255) cTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTta > 1:571639/1‑251 (MQ=255) gtgATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTa > 1:271648/1‑166 (MQ=255) gtgATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAAtcctc > 1:89719/1‑225 (MQ=255) atgaATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAAc < 1:142275/250‑1 (MQ=255) atgaATCAGCCAGTCTCACCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAAc < 1:142292/250‑1 (MQ=255) 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gCAGAGGATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTA‑ACACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAggg < 1:592711/250‑1 (MQ=255) ggATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACgg < 1:205243/136‑1 (MQ=255) ggATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAAc > 1:798582/1‑250 (MQ=255) ggATATTGATTTCTCCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAAc > 1:233774/1‑250 (MQ=255) 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ctcCTTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAGTAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGTTAGATTTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAACCACCGATTTGCACATTCGGCGGCGGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATGATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAACCATAATTCGGCGt < 1:116363/251‑1 (MQ=255) | ATGTGAATGCGCCCTGCGTGGTTTCGGTAATCGGGCTTTCTGTTCCCGCGCCGTGATAAAGGCTATGTTCCTCACCATAAGGCAGGAAGATTACATCGCCCGGTTTTAGATGGCAGGTTTGATTTTTCAGCCGAATCTGACATTCGCCGCGTGACACAATGTGAAATTTGCCGATTAAATTGGGTTCCTGCTTGTGATGAATCAGCCAGTCTCCCCGGAAACGGCAGAGGATATTGATTTCTCCCTCAATGCCCGATAATCGGATAAGCTGATCTAAATAGTCCATATTTCAATGTTTGCCCTGATTAAACGAAGAAGCCTATCACAAGGTGATAAGCTTCAGCCAGA‑TTTACAATTAGACGGATTGTTTCGCCTTTAGCCATCGATTAGCGCATTCGGCGGCAGCAACCAATCCTCCTGCCATCATGATAATATCTTTAATAACCAGCCGCCCTGCCGCAGATAAATAAGGGAAACCATAATTCGGCGT > 1/638864‑639353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |