| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 638,726 | A→G | intergenic (+141173/‑60617) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 638,726 | 0 | A | G | 100.0% | 241.7 / NA | 85 | intergenic (+141173/‑60617) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/39); total (46/39) | |||||||||||
ACTTTCCGCTAAGGCTTCCATGCTCCAACTTTTTTTAGGCGTTTCCACCATAGCATTTACCGCATTTTTTAAACGTTTATCCTGCAAAGCGCCGAGAATGCCTTGGTTGACTTGATGATGTTGCAGATAATCTCTGATCAGGTAAGTAAAGAGAATATTGCATAGCGCGTTGACCACCACTTTGTTGCCTAAATTTTCCTCAGTTTCTTTGCGAAGGAGCTCCAGCAACGCCATGATGGCGGAGTTATTGCTTGAAAGATACCAATGGGGCAAGTTAAAAAGCAGGTTTTGGGCAAGATTGAGATAACGGAAATAACCGCAGAGCATTTCAAAATCATCGGATTCGCTTGTGCTGTTACGATGCAATGTGAATGCGCCCTGCGTGGTTTCGGTAATCGGGCTTTCTGTTCCCGCGCCGTGATAAAGGCTATGTTCCTCACCATAAGGCAGGAAG > 1/638499‑638952 | aCTTTCCGCTAAGGCTTCCATGCTCCAGCTTTTTTTAGGCGTTTCCACCATAGCATTTACCGCATTTTTTAAACGTTTATCCTGCAAAGCGCCGAGAATGCCTTGGTTGACTTGATGATGTTGCAGATAATCTCTGATCAGGTAAGTAAAGAGAATATTGCATAGCGCGTTGACCACCACTTTGCTGCCTAAATTTTCCTCGGTTTCTTTGCGCAGTAATTCCAGTAGCGCCATGATGGCGATGTTATTg > 1:10263/1‑250 (MQ=255) 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ACTTTCCGCTAAGGCTTCCATGCTCCAACTTTTTTTAGGCGTTTCCACCATAGCATTTACCGCATTTTTTAAACGTTTATCCTGCAAAGCGCCGAGAATGCCTTGGTTGACTTGATGATGTTGCAGATAATCTCTGATCAGGTAAGTAAAGAGAATATTGCATAGCGCGTTGACCACCACTTTGTTGCCTAAATTTTCCTCAGTTTCTTTGCGAAGGAGCTCCAGCAACGCCATGATGGCGGAGTTATTGCTTGAAAGATACCAATGGGGCAAGTTAAAAAGCAGGTTTTGGGCAAGATTGAGATAACGGAAATAACCGCAGAGCATTTCAAAATCATCGGATTCGCTTGTGCTGTTACGATGCAATGTGAATGCGCCCTGCGTGGTTTCGGTAATCGGGCTTTCTGTTCCCGCGCCGTGATAAAGGCTATGTTCCTCACCATAAGGCAGGAAG > 1/638499‑638952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |