| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 70,664 | T→A | intergenic (–/+60470) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 70,664 | 0 | T | A | 100.0% | 137.7 / NA | 52 | intergenic (–/+60470) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (26/26); total (26/26) | |||||||||||
ATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATTTTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGATTGGGGTAACGC > 1/70420‑70909 | aTTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATAc < 1:521875/251‑1 (MQ=255) cGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCACTGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCa > 1:290909/1‑251 (MQ=255) tatGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATg < 1:793841/251‑1 (MQ=255) gCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGtt > 1:354683/1‑250 (MQ=255) gTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGTATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATg > 1:679585/1‑201 (MQ=255) gTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAACTATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATtgt > 1:446617/1‑251 (MQ=255) gTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAat < 1:628118/223‑1 (MQ=255) gCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTACGGTTAAAATTCATTGTGtttt > 1:883257/1‑251 (MQ=255) ccTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGAc < 1:760591/250‑1 (MQ=255) cTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCg > 1:484538/1‑251 (MQ=255) aGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCa < 1:869464/250‑1 (MQ=255) gCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCAcc < 1:598585/250‑1 (MQ=255) tAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAAt > 1:371923/1‑250 (MQ=255) ccccTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATcc > 1:535259/1‑249 (MQ=255) gttgtACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTc > 1:451990/1‑190 (MQ=255) gttgtACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAAt < 1:651009/242‑1 (MQ=255) tCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTATCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAgg < 1:181100/251‑1 (MQ=255) gTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATAc < 1:129942/107‑1 (MQ=255) atCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATtg > 1:692465/1‑169 (MQ=255) atCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATcc < 1:833819/201‑1 (MQ=255) ccTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAAt > 1:765000/1‑244 (MQ=255) ccTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATgg < 1:380859/230‑1 (MQ=255) ccTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaaca > 1:698266/1‑251 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCAcc < 1:526186/174‑1 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAAtg < 1:12172/207‑1 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTc > 1:602743/1‑237 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaacaa > 1:525251/1‑251 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaacaa < 1:136286/251‑1 (MQ=255) ctctAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAAGAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaacaa < 1:439080/251‑1 (MQ=255) gagCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCa > 1:556255/1‑251 (MQ=255) aatccaatGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCa < 1:146659/251‑1 (MQ=255) atccaatGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCAc < 1:92082/251‑1 (MQ=255) aTTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGt > 1:476597/1‑196 (MQ=255) aTTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCa > 1:816594/1‑250 (MQ=255) cTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGcc < 1:721057/170‑1 (MQ=255) cTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCt < 1:408851/220‑1 (MQ=255) cTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGa > 1:526151/1‑251 (MQ=255) cTCATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGa > 1:367447/1‑251 (MQ=255) cATAATGTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGAtt < 1:599645/251‑1 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAGATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGATTGGGGTa > 1:607180/1‑251 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATccc > 1:267785/1‑121 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGac > 1:138088/1‑126 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAAt < 1:377700/134‑1 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAAtg > 1:104582/1‑147 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGAt > 1:602347/1‑167 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGc < 1:762840/200‑1 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTcc < 1:368739/205‑1 (MQ=255) gTATAAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTc < 1:490820/204‑1 (MQ=255) ataAAATATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACcaac > 1:560362/1‑187 (MQ=255) aaaaTATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGATTGGGGTAACGc < 1:745208/251‑1 (MQ=255) aaaaTATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGATTGGGGTAACGc < 1:20714/251‑1 (MQ=255) aaaTATTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGAc > 1:420718/1‑223 (MQ=255) | ATTTGGCAATGTAAACCAAACGATATGCCCCTGAAATATCCCTCACTCGAATTTCCATTACACCGGAACCCAGGTTCTGCATTGCCTTAAAATCCCGAGGCGATAACCCCTGTTGTACGAGGTCAAGATCGAAACCTAATTCCCGTTTTATATTATCCGGAAACGCCTTAACATCCTCTAAGCTAGAGCCAATCCAATGAATTGGTTTCCGTTCTATTTGTTGCCTACTCATAATGTATAAAATTTTATACCAAAATAAATCATAATGCCAATGTTCACTCGGCGCGTCGTTTAATATGTCAAAGTGCGGTTAAAATTCATTGTGTTTTTTGACCGCACTTTTTCCACCTAATCCCTCGACACCCGAATCGTTTGTTTAATGTGTTTGAGGTTCGCCACGATGGTGAATGTCATTACCACCAACAACGCCCAGGCACTCCACTTGCTGGCATGCACTAACGACCACGCGCCGATTTGATTGGGGTAACGC > 1/70420‑70909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |