| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 626,694 | A→G | intergenic (+129141/‑72649) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 626,694 | 0 | A | G | 100.0% | 273.4 / NA | 96 | intergenic (+129141/‑72649) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (55/41); total (55/41) | |||||||||||
TTGCTTAGCCCTCGCTGCACTCTTTATTTTCCGCAGTAAAAACATCGGTGTACTCGCATTGGCTGCCATTTTGACGCTGTTTGCCGAAATGTTGGGACGCAATTTGTTTTATGCTGCGCACATGACCCTTGGCATGGCGGTAGGTGGTTAATTGTCGTCAATAACTAAAAAAGTGCGGTCATTTTATCAGGAGTTTTTATGGATAACGGATTAATGCAATGGATTTCCACCACAGGGCGGTTATTGAGCGCGGCGTTTTATTATGCGCCCGATGACGCGCGGGTTGCTTCTGTGTTGTGTTTTTTTGAACGGGAAAATTGGCAGCAGGAATGGGCGCCCTTTGTGGATGAAAAAACGTTGGAAAAAACCACCGCACTGTTTGCCGAAGGTTTACAGCAACCGCTTGCTGAACAATATCAGGCGTTGTTTATCGGCCCGAATGCGCTGCCTGCGCCGCCTTGGGGTTCCGTCTATTTG > 1/626448‑626924 | ttgCTTAGCCCTCGCTGCACTCTTTATTTTCCGCAGTAAAAACATCGGTGTACTCGCATTGGCTGCCATTTTGACGCTGTTTGCCGAAATGTTGGGACGCAATTTGTTTTATGCTGCGCACATGACCCTTGGCATGGCGGTAGGTGGTTAATTGTCGTCAATAACTAAAAAAGTGCGGTCATTTTATCAGGAGTTTTTATGGATAACGGATTAATGCAATGGATTTCCACCACAGGGCGGTTATTGGgcg < 1:785902/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |