| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 604,741 | A→G | intergenic (+107188/‑94602) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 604,741 | 0 | A | G | 100.0% | 230.5 / NA | 83 | intergenic (+107188/‑94602) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (28/55); total (28/55) | |||||||||||
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(MQ=255) ttCCAGTTGTCCCAATGGGCTTTGTAATCCGCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTc > 1:75426/1‑132 (MQ=255) ccAATGGGCTTTGTAATCCGCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAagag < 1:845066/129‑1 (MQ=255) gCTTTGTAATCCGCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAaat < 1:715016/173‑1 (MQ=255) cTTTGTAATCCGCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAATCCACAATATCCACTTTCCACGGCAAATCCGATTCGGAGAAAGcc < 1:79007/251‑1 (MQ=255) cTTTGTAATCCGCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAATCCACAATATCCACTTTCCACGGCAAATCCGATTCGGAGAAAGcc < 1:784692/251‑1 (MQ=255) ttGTAATCCGCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGa > 1:680030/1‑147 (MQ=255) gCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGAtt < 1:139734/101‑1 (MQ=255) gCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAATCCACAATATCCACTTTCCACGGCAAATCCGATTCGGAGAAAGCCTCCGTTAAAtt > 1:341617/1‑251 (MQ=255) 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ggAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAAt < 1:362146/144‑1 (MQ=255) gaagaaGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAATCCACAat < 1:868627/150‑1 (MQ=255) aagaagGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAATCCACAATATCCACTTTCCACGGCAAATCCGATTCGGAGAAAGCCTCCGTTAAATTTGCCAAGGTTTTCATCGAAAGTGGCGATTCGCCAATAATTGCcaaatccaaatc < 1:768838/251‑1 (MQ=255) aagaagGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGGCGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAATCCACAATATCCACTTTCCACGGCAAATCCGATTCGGAGAAAGCCTCCGTTAAATTTGCCAAGGTTTTCATCGAAAGTGGCGATTCGCCAATAATCGCcaaatccaaatc < 1:94549/251‑1 (MQ=255) 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GGTTATATTCATATTTAAAATAGGCGAAAAAATGCCCGCGCACCTGCCAGCCGTTCGTCCAGCTTTCAATATGCGGTTTGGCAAAGTGCGAACCAAGCGCCGCGGAAACCTGCAAAATCGTCGCTTTCCAGTTGTCCCAATGGGCTTTGTAATCCGCCTTAATGCGCGGAATCTCTTCCGGACAAAATTTTTTCATTTGGGCGAATTGGAAGAAGGGAATGTTGAAAAGATCGCAGGCGTTGACGTTAATTAGATTCACTAAGAGCATCCTTTTTTATGTAATTGCTTACTGAATAACCTCAAAACACTGCAAAATAATCTGTTTAAAGGCATCATTCGTCACTGCCCAATCCACAATATCCACTTTCCACGGCAAATCCGATTCGGAGAAAGCCTCCGTTAAATTTGCCAAGGTTTTCATCGAAAGTGGCGATTCGCCAATAATTGCCAAATCCAAATCGGAATACGTTTTGGCGTATCC > 1/604499‑604979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |