| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 571,819 | T→G | intergenic (+74266/‑127524) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 571,819 | 0 | T | G | 100.0% | 174.0 / NA | 62 | intergenic (+74266/‑127524) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (26/36); total (26/36) | |||||||||||
CAGAAAACATAGATTTAATAATGATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTGTTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATTTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGAAAATTATAATTTAGATACAATCAAAAATTATAATTTCGCTTGTCCACAAAATGACACAACACATATTTC > 1/571594‑572002 | cAGAAAACATAGATTTAATAATGATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGa < 1:342685/250‑1 (MQ=255) gATTTAATAATGATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATgg < 1:681153/225‑1 (MQ=255) aataatGATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTaca > 1:247579/1‑251 (MQ=255) gATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTg > 1:514074/1‑226 (MQ=255) gATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTg < 1:816108/226‑1 (MQ=255) gATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTacac > 1:644418/1‑246 (MQ=255) gATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTa > 1:606248/1‑251 (MQ=255) tAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGt < 1:259842/251‑1 (MQ=255) aaaTCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTg < 1:373682/222‑1 (MQ=255) aaaTCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTc < 1:188097/251‑1 (MQ=255) aaTCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAAt > 1:720417/1‑207 (MQ=255) tgttgtTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACTCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCtattat < 1:447972/250‑1 (MQ=255) tgttgtTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCtattat < 1:386660/250‑1 (MQ=255) tgttgtTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCtattat < 1:817334/250‑1 (MQ=255) tgttgtTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCtattat < 1:628373/250‑1 (MQ=255) gttAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCtattat < 1:65215/246‑1 (MQ=255) gttAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTag > 1:521494/1‑251 (MQ=255) gttAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTag > 1:698019/1‑251 (MQ=255) ccATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCtatta < 1:225061/237‑1 (MQ=255) aTGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCAcc < 1:365335/250‑1 (MQ=255) aTGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACattat < 1:431505/250‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:674030/251‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:285367/251‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:794023/251‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:809085/251‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:139509/251‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCAGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:316172/251‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAgaga < 1:602193/223‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg > 1:832704/1‑250 (MQ=255) cGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTgtgt < 1:523605/251‑1 (MQ=255) tGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTg < 1:100481/175‑1 (MQ=255) tGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTc > 1:370333/1‑204 (MQ=255) tGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCAcc > 1:615070/1‑231 (MQ=255) tGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:98150/245‑1 (MQ=255) tGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg > 1:223396/1‑245 (MQ=255) tGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTta > 1:272487/1‑251 (MQ=255) gCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTGTTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCtattat > 1:446849/1‑209 (MQ=255) gCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtgtg < 1:321041/246‑1 (MQ=255) tAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGaa < 1:315929/251‑1 (MQ=255) aTTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGt < 1:590107/179‑1 (MQ=255) aCCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTagag > 1:139544/1‑179 (MQ=255) aCCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGa < 1:348225/229‑1 (MQ=255) cTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACattat < 1:152386/197‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTc > 1:512776/1‑152 (MQ=255) gATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCAcc < 1:170398/171‑1 (MQ=255) tCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGAtc < 1:75732/102‑1 (MQ=255) tCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTagag > 1:326073/1‑152 (MQ=255) tCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACattat < 1:114245/178‑1 (MQ=255) tCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTtaataa > 1:478780/1‑190 (MQ=255) caGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTa < 1:634590/158‑1 (MQ=255) gAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACattat > 1:782631/1‑173 (MQ=255) aTTTTTGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGAAAATTATAATTTAGATACAATCAAAAATTATAATTTCGCTTGTCCACAAAATGACACAACACATATTTc < 1:706535/251‑1 (MQ=255) tttttGCTTATTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATtg < 1:748129/159‑1 (MQ=255) gATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTc > 1:539391/1‑104 (MQ=255) gATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAgaga < 1:848050/118‑1 (MQ=255) tAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACattat > 1:436779/1‑139 (MQ=255) aGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTacac > 1:80932/1‑90 (MQ=255) gTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGa > 1:385111/1‑161 (MQ=255) aTGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCAcc > 1:86486/1‑121 (MQ=255) ctcCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTagag > 1:617123/1‑102 (MQ=255) ccTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGAAAATTATAAttt > 1:612818/1‑162 (MQ=255) cTATATTTCTCAATGTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGAAAATTATAATTTAGATACAATCAAAAATTATAATTTCGCTTGTCCACAAAATg > 1:71352/1‑182 (MQ=255) | CAGAAAACATAGATTTAATAATGATTAAATCGGTGTTGTTAAAACCCATTGGCGATGCTATTGGCGATGCCGTTGCCCATACCGCGCATTTAAAACAATTAAAACTTGCCAACCCGGAACTGGTGATTGGCGTGATCGTCACAGAAAGGAATCGGGACATTTTTGCTTGTTCCGATTTAGTTGATGTTCTCCTGGAGGACAAACCTTTAACCTATATTTCTCAATTTCGCAAATGGGATCTCTATTTGGATTTTCAGCCAACTTACACCACTAAGTCTATTATTTTAGAGAAGCTGTTATCACCGAAGTACATTATTGTGTTTAATAAAAAACATAAGGAAAATTATAATTTAGATACAATCAAAAATTATAATTTCGCTTGTCCACAAAATGACACAACACATATTTC > 1/571594‑572002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |