| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 475,995 | T→G | intergenic (‑59173/‑21468) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 475,995 | 0 | T | G | 100.0% | 228.0 / NA | 80 | intergenic (‑59173/‑21468) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (40/40); total (40/40) | |||||||||||
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atgatTGCATTACCGGGAAATCGCTACGCAATGGCATTAAACTTAGAAAGAGATTCTGTTGGTGCAGTGGTAATGGGGCCTTATGCCGATCTTGCAGAAGGCATGGAAGTCCAATGTACCGGCCGTATTCTTGAAGTGCCTGTAGGTCGCGGTTTATTAGGTCGTGTGGTAAATACCCTTGGTCAACCGATTGACGGCAAAGGTGAAATTGAAAATGACGGTTTTTCTCCAATTGAAGTCATTGCACCggg < 1:21370/251‑1 (MQ=255) tgatTGCATTACCGGGAAATCGCTACGCAATGGCATTAAACTTAGAAAGAGATTCTGTTGGTGCAGTGGTAATGGGGCCTTATGCCGATCTTGCAGAAGGCATGGAAGTCCAATGTACCGGCCGTATTCTTGAAGTGCCTGTAGGTCGCGGTTTATTAGGTCGTGTGGTAAATACCCTTGGTCAACCGATTGACGGCAAAGGTGAAATTGAAAATGACGGTTTTTCTCCAATTGAAGTCATTGCACCGGgt > 1:279628/1‑251 (MQ=255) cATTACCGGGAAATCGCTACGCAATGGCATTAAACTTAGAAAGAGATTCTGTTGGTGCAGTGGTAATGGGGCCTTATGCCGATCTTGCAGAAGGCATGGAAGTCCAATGTACCGGCCGTATTCTTGAAGTGCCTGTAGGTCGCGGTTTATTAGGTCGTGTGGTAAATACCCTTGGTCAACCGATTGACGGCAAAGGTGAAATTGAAAATGACGGTTTTTCTCCAATTGAAGTCATTGCACCGGGTGTAAt < 1:124683/250‑1 (MQ=255) 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GCAAATGAGTTGCAATTATAAGAGGATTAGAAGATGCAACTAAATTCAACTGAAATTAGTGAATTAATAAAAAAACGCATTGCCCAGTTTAATGTAGAAAGCGAAGCGCGTAATACGGGAACAATCGTTTCAGTCAGCGATGGTATCATTCGTATTCACGGTTTAAGTGAAGTGATGCAAGGTGAGATGATTGCATTACCGGGAAATAGCTACGCAATGGCATTAAACTTAGAAAGATATTCTGTTGGTGCAGTGGTAATGGGGCCTTATGCCGATCTTGCAGAAGGCATGGAAGTCCAATGTACCGGCCGTATTCTTGAAGTGCCTATAGGTCGCGGTTTATTAGGTCGTGTGGTAAATACCCTTGGTCAATCGATTGACGGCAAAGGTGAAATTGAAAATGACGGTTTTTCTCCAATTGAAGTCATTGCACCGGGTGTAATTGAACGTAAGTCCGTTGATCAACCTGTTCAAACC > 1/475758‑476234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |