| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 474,516 | A→C | intergenic (‑57694/‑22947) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 474,516 | 0 | A | C | 100.0% | 236.9 / NA | 86 | intergenic (‑57694/‑22947) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (40/46); total (40/46) | |||||||||||
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cttGCATTCGCTGCATTGGGCACGGCAATCGGCTTTGCTATCTTAGGCGGTAAATTCTTAGAATCATCCGCCCGTCAGCCGGAACTAGCTTCAAGCCTACAAACTAAAATGTTTATCGTGGCAGGTCTTTTAGATGCGATTGCGATGATTGCAGTTGGTATTTCTTTACTTTTCATTTTTGCAAACCCATTCATCGGTTTATTACAATAATCACCTTATTTGCTTATCAACGTGAAGCAGGCAGATTAagg < 1:532459/251‑1 (MQ=255) cttGCATTCGCTGCATTGGGCACGGCAATCGGCTTTGCTATCTTAGGCGGTAAATTCTTAGAATCATCCGCCCGTCAGCCGGAACTAGCTTCAAGCCTACAAACTAAAATGTTTATCGTGGCAGGTCTTTTAGATGCGATTGCGATGATTGCAGTTGGTATTTCTTTACTTTTCATTTTTGCAAACCCATTCATCGGTTTATTACAATAATCACCTTATTTGCTTATCAACGTGAAGCAGGCAGATTAagg < 1:19685/251‑1 (MQ=255) ttGCATTCGCTGCATTGGGCACGGCAATCGGCTTTGCTATCTTAGGCGGTAAATTCTTAGAATCATCCGCCCGTCAGCCGGAACTAGCTTCAAGCCTACAAACTAAAATGTTTATCGTGGCAGGTCTTTTAGATGCGATTGCGATGATTGCAGTTGGTATTTCTTTACTTTTCATTTTTGCAAACCCATTCATCGGTTTATTACAATAATCACCTTATTTGCTTATCAACGTGAAGCAGGCAGATTAagga < 1:48585/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |