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1:140082/251‑1 (MQ=255) tccGCAACTTGCCGGATTATTCGGTATTCACTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACGTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAGCTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGtt < 1:187346/251‑1 (MQ=255) gATTATTCGGTATTCACTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATg > 1:573552/1‑251 (MQ=255) attattCGGTATTCACTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGt < 1:862063/251‑1 (MQ=255) ttattCGGTATTCACTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTc < 1:240480/240‑1 (MQ=255) ttCGGTATTCACTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGc < 1:449951/251‑1 (MQ=255) ttCGGTATTCACTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGc < 1:789601/251‑1 (MQ=255) 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cTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCt < 1:74876/215‑1 (MQ=255) cTATTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTaa > 1:852907/1‑251 (MQ=255) aTTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCtt < 1:98593/127‑1 (MQ=255) aTTTAAGAACCGTCCCTACGGCAGATATTAGCGCTACTTTGGGGATGTCGATTTGCGTCTTCTTCCTGATTCTTTTCTATACGGTTAAATCCAAAGGGGTTAGCGGTTTAGTTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGaa > 1:599628/1‑176 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |