| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 470,338 | A→G | intergenic (‑53516/‑27125) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 470,338 | 0 | A | G | 100.0% | 259.5 / NA | 94 | intergenic (‑53516/‑27125) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (40/54); total (40/54) | |||||||||||
GATCAGGCTTATATTGGTGTGTTGGTGGATGATCTTTGCACCCTTGGTACTAAAGAACCATATCGCGTGTTTACTTCCCGTGCGGAATATCGCTTGTTGTTACGTGAAGATAACGCCGATATTCGTTTAACGCCGATTGCGCACGAATTAGGTTTAATTGATGAAGCGCGTTGGGCGCGTTTTAATCAAAAAATGGAAAATATTGAGCTTGAACGCCAACGTTTACGCAGCATTTGGTTGCACCCACGTTCAGAATATTTGGAAGAAGCGAATAAAGTGTTGGGTAGTCCATTGGTGCGCGAAGCCAACGGTGAAGATTTATTGCGTCGCCCGGAAATGAACTATGAGATTTTAACTTCTTTGACGCCTTATCAACCAGCAATGGAAGATAAAGAAGCAGTGGAACAAGTGGAAATTGCTATTAAATATCAAGGTTATATTGAACATCAAGAAGAAGAAATCGAAAAACAAAAACGCCACGAAAA > 1/470093‑470577 | gATCAGGCTTATATTGGTGTGTTGGTGGATGATCTTTGCACCCTTGGTACTAAAGAACCATATCGCGTGTTTACTTCCCGTGCGGAATATCGCTTGTTGTTACGTGAAGATAACGCCGATATTCGTTTAACGCCGATTGCGCACGAATTAGGTTTAATTGATGAAGCGCGTTGGGCGCGTTTTAATCAAAAAATGGAAAATATTGAGCTTGAACGCCAACGTTTACGCAGCATTTGGTTGCACCCGCGtt > 1:547888/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |