| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 460,135 | T→G | intergenic (‑43313/‑37328) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 460,135 | 0 | T | G | 100.0% | 179.8 / NA | 66 | intergenic (‑43313/‑37328) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (29/37); total (29/37) | |||||||||||
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1:499263/250‑1 (MQ=255) tAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGGTTTTTC‑TTG‑GGATA‑G‑G‑CAAAA‑TGTAAATAGTTTATTTGG‑ACGGGGGCTTTCT‑TTTTTATCCGAAAAAT‑CACCGCACTTTTATTTTTTTCCA‑CCGGCCTATTCAACCGCGTTAAGA‑TTTTTTCCGCAGCCGCTTTGCCGTTCATCGCCACC‑TGGCAGAAAGAACCAAGAAAGAGCCATGGGAAGAAAAATTCGGAAGCCAGTaaaa > 1:379935/1‑251 (MQ=255) aaCTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCC‑TCG‑GAATA‑G‑G‑CAAAA‑TGTAAATCGTTAATTTGC‑ACGGTGAC‑TTCA‑TTTTTAACCGGAAAATCCACCGCACTTTTATTTTCTTCCA‑CCGGCGTATCCAACAGCGTAAAGA‑TTTTTTCCGAAGCAGCTTTGCCGTTCATCGCCACA‑TGGAAGAAGGAACCAAGCAAGCGCAATGGAATGAAAAATTCGGAAGCCAGTAAAAt < 1:865289/251‑1 (MQ=255) cTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGCGGGGTTTTTCC‑‑CT‑GAAAA‑G‑G‑CAAAA‑AGGAAAACGTTTATTTTC‑ACGGTGAC‑TTTA‑TTTTTAACCGGGAAATCCACCCCCCCTTTATTTT‑TTCCA‑CCCGCGTATTCAACAGCGTAAAGATTTTTTTCCCAA‑CCGCCTTGCCCTTTCTCCCCCCACCGGAGAAAGAAACCAA‑CAAGCGCCATGGAATGAAAAAATCTGAAGCCAGTAAAATaaa > 1:205256/1‑251 (MQ=255) gCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCC‑TCG‑GAATA‑G‑G‑CAAAA‑TGTAAATCGTTAATTTGC‑ACGGTGAC‑TTCA‑TTTTTAACCGGAAAATCCACCGCACTTTTATTTTCTTCCA‑CCGGCGTATCCAACAGCGTAAAGA‑TTTTTTCCGAAGCAGCTTTGCCGTTCATCGCCACA‑TGGAAGAAGGAACCAAGCAAGCGCAATGGAATGAAAAATTCGGAAGCCAGTAAAATAAACAacac < 1:99119/250‑1 (MQ=255) aTGCTGAGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCC‑TCG‑GAATA‑G‑G‑CAAAA‑TGTAAATCGTTAATTTGC‑ACGGTGAC‑TTCA‑TTTTTAACCGGAAAATCCACCGCACTTTTATTTTCTTCCA‑CCGGCGTATCCAACAGCGTAAAGA‑TTTTTTCCGAAGCAGCTTTGCCGTTCATCGCCACA‑TGGAAGAAGGAACCAAGCAAGCGCAATGGAATGAAAAATTCGGAAg < 1:731589/226‑1 (MQ=255) aGGGTTAAGCCGTTAATGGC‑GGGTTTTTCC‑TCG‑GAATA‑G‑G‑CAAAA‑TGTAAATCGTTAATTTGC‑ACGGTGAC‑TTCA‑TTTTTAACCGGAAAATCCACCGCACTTTTATTTTCTTCCA‑CCGGCGTATCCAACAGCGTAAAGA‑TTTTTTCCGAAGCAGCTTTGCCGTTCATCGCCACA‑TGGAAGAAGGAACCAAGCAAGCGCAATGGAATGAAAAATTCGGAAGCCAGTAAAATAAACAACACCACGCCGaaaa < 1:461499/250‑1 (MQ=255) | TGATAACACCATTAGCATATTTTCCCGCAAGCTGCCTTTGAAAATGTAACTGCTGTGACTTACCAGCGAAATGTGGCGATATAAGGAATGGCGGTTAATCTGTTTAATATCGATGCCGTTAAACAAAATTTCGCCTTGTTGCGCCTGATAGAACCCCATTAGTAAAGATACCAAGGTCGATTTGCCACAACCGCTTTTGCCCACGAAAACCGTTAACTGTTTCGGCTGGATGCTGAGGGTTAAGCCTTTAATGGC‑GGGTTTTTCC‑TCG‑GAATA‑G‑G‑CAAAA‑TGTAAATCGTTAATTTGC‑ACGGTGAC‑TTCA‑TTTTTAACCGGAAAATCCACCGCACTTTTATTTTCTTCCA‑CCGGCGTATCCAACAGCATAAAGA‑TTTTTTCCGAAGCAGCTTTGCCGTTCATCGCCACA‑TGGAAGAAGGAACCAAGCAAGCGCAATGGAATGAAAAATTCGGAAGCCAGTAAAATAAACAACACCACGCCGAAAA > 1/459889‑460373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |