| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 446,792 | C→A | intergenic (‑29970/‑50671) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 446,792 | 0 | C | A | 100.0% | 224.1 / NA | 85 | intergenic (‑29970/‑50671) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (45/40); total (45/40) | |||||||||||
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aaaCTAGAGATAATTCGAGAACCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTAcctc > 1:612945/1‑249 (MQ=255) aCTAGAGATAATTCGAGAACCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGc > 1:885377/1‑219 (MQ=255) aCTAGAGATAATTCGAGAACCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGAACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTg > 1:860371/1‑161 (MQ=255) agagATAATTCGAGAACCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTACCTCCTTAtt > 1:161934/1‑250 (MQ=255) gaTAATTCGAGAACCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAatat < 1:434807/113‑1 (MQ=255) aaTTCGAGAACCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTACCTCCTTATTCTataat < 1:649931/251‑1 (MQ=255) aCCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTACCTCCTTATTCTataa > 1:641096/1‑241 (MQ=255) aaaTGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAatat > 1:248360/1‑98 (MQ=255) 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gTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTACCTCCTTATTCTATAATAAACTAAAATTTGGCTTAGGATTGTATAc < 1:604731/250‑1 (MQ=255) aaaTTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTACCTCCTTATTCTATAATAAACTAAAATTTGGCTTAGGATTGTATACCtt < 1:147462/251‑1 (MQ=255) ccGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTACCTCCTTATTCTATAATAAACTAAAATTTGGCTTAGGATTGTATACCTTTCTCTg < 1:250505/251‑1 (MQ=255) gCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCa < 1:348920/53‑1 (MQ=255) 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ttCAAACCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTTGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAAt > 1:723637/1‑165 (MQ=255) | TCCTAAACGTCCCATAGACCATGCCGTTTCAGGTTGATGAGTCATCCAAGATAACTGAGGTCCATCAAATTTACCGTATATTTCAATGATCTTATCTAAAAACAACAGAGTATCTTTATCACTTTCTTTAATAATTTGCTGTTTCCCCCATATATCAGTACCAAAACTAGAGATAATTCGAGAACCAAATGGTTTGAACTCATGGTAAATTTCCGGTAGCACCGGACCAAATTGCCATCTTTCAACCCCCCCCTCAAACAAAGGCTTACCATAAAGCTTAATATACCAAGATTGCGTATAAAACATTAATTTTCGTAGTTTCATTGGAGTTAAATTAGAAATTTCTCCAATATTAGCCTTGCCAATGAATGAGTTGGCGATAGCAATAGATGAATAACCCACAATTTACCTCCTTATTCTATAATAAACTAAAATTTGGCTTAGGATTGTATACCTTTCTCTGTTATAAACCAATACTGT > 1/446547‑447026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |