| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 445,362 | A→G | intergenic (‑28540/‑52101) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 445,362 | 0 | A | G | 100.0% | 232.6 / NA | 81 | intergenic (‑28540/‑52101) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/44); total (37/44) | |||||||||||
ATGCCACCACCGCCGAACAAACCCTACACACCACCAACGGCAATGCCAAACTCGCGATCATGATGTTGTTAAGCGGATTGGATAAAACGCAGGCGGAAGCCGTGTTAGTGCAACATAAGGGAAGATTACAGAACGCCTTGGTGGGGTGAAAAACGCCGGAAAAAACGACCGCACTTTATAGGCTTTAAAAGCCGAGGGCAAGTACGGGAATTGGACTTGAAATTATTTGGAGAAACGAAGTGTATACAACAAAAAAATTACTATCTATTCATTAGTAAGTTTTCCATTCTATTTATGAAGCTAGTTGTATCTAAGAAATAATTAGGGTACGCATCTTTTAATTGGTTTACATCATCAACCGAAACTAGCACCACATCAAGAAATTCATTCTTAAAAGAATCTTGTTCATAATGGGAGTATACCTGCTCAGCTTTAAAT > 1/445117‑445554 | aTGCCACCACCGCCGAACAAGCCCTACACACCACCAACGGCAATGCCAAACTCGCGATCATGATGTTGTTAAGCGGATTGGATAAAACGCAGGCGGAAGCCGTGTTAGTGCAACATAAGGGAAGATTACAGAACGCCTTGGTGGGGTGAAAAACGCCGGAAAAAACGACCGCACTTTATAGGCTTTAAAAGCCGAGGGCAAGTACGGGAATTGGACTTGAAATTATTTGGAGAAACGAAGTGTATgcaac < 1:241146/250‑1 (MQ=255) ccaccGCCGAACAAACCCTACACACCACCAACGGCAATGCCAAACTCGCGATCATGATGTTGTTAAGCGGATTGGATAAAACGCAGGCGGAAGCCGTGTTAGTGCAACATAAGGGAAGATTACAGAACGCCTTGGTGGGGTGAAAAACGCCGGAAAAAACGACCGCACTTTATAGGCTTTAAAAGCCGAGGGCAAGTACGGGAATTGGACTTGAAATTATTTGGAGAAACGAAGTGTATGCAACaaaaaaa < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |