| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 429,279 | T→C | intergenic (‑12457/‑68184) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 429,279 | 0 | T | C | 100.0% | 255.7 / NA | 90 | intergenic (‑12457/‑68184) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (46/44); total (46/44) | |||||||||||
TTTTATATCCTAAGCGTTCCTACCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTGCTCATGTTTTAGCTATATCCAAATTTTTAAAAGTCTGAATCTCCGTCGGAGTTATTTAGAACAGTTTTCAACTCTCAGAAAGAAGCAATATGGCACGCACAATCACGCCGTTAAACAGCACGAAAATAGACAAAGCCAAGCCGCAGGAAAAGGAATTTA‑CCCTATCCGATGGCAAAGGGCTTTATCTGTTGGTTAAACCCAATGGGGCTAAGTTATGGCGG‑TTTAACTATTACAAGCCTTTCACGCAACCAAAGAAAAGGGCGTTAATTGGCGTTGGCAAATACCCTGATATTTCCTTACAGCAGGCAAGAGCAATTAGAGAGGAATATTTATCTTTACTTGCGCAGAA > 1/429036‑429517 | ttttATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACAATCACACCGCTAAACAg > 1:610742/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |