| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 429,025 | C→T | intergenic (‑12203/‑68438) | unknown ← / → unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 429,025 | 0 | C | T | 100.0% | 221.4 / NA | 82 | intergenic (‑12203/‑68438) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑SeC(p)‑TCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (33/49); total (33/49) | |||||||||||
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ggggTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAAACCAAAGCAAACTTATCAAATCCTAAAAGCCCTTGAAAGTATTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCtatacctgattttt > 1:453150/1‑241 (MQ=255) gTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAAACCAAAGCAAACTTATCAAATCCTAAAAGCCCTTGAAAGTATTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTg < 1:804521/159‑1 (MQ=255) aaCTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAAACCAAAGCAAACTTATCAAATCCTAAAAGCCCTTGAAAGTATTAACTTTAAGGGCtttttat < 1:709424/90‑3 (MQ=255) aCTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAAACCAAAGCAAACTTATCAAATCCTAAAAGCCCTTGAAAGTATTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCg < 1:386554/99‑1 (MQ=255) aCTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAAACCAAAGCAAACTTATCAAATCCTAAAAGCCCTTGAAAGTATTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACt > 1:851032/1‑182 (MQ=255) 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1:881967/2‑165 (MQ=255) gtatTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGt > 1:369005/2‑203 (MQ=255) atTAACTTTAAGGGC‑TTTTTATATCCTAAGCGTTCCTATCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTACTCATGTTTTAGCTATACCTGATTTTTTAAAAGTCTGAATTGCCGTCAGAGTTATTCAGAATAATTTTCAACTCTCAGAACTAAGCGATATGGCACGCACaa > 1:147236/1‑251 (MQ=255) | CAAACCAAAACGAGCTCGTGTGGAAGCCACCGTTTGAGGATCGAAGCATTAAATTAAATCAAACTAGCTTAATTGTCGCGTGTCCGTCCGCAGGATTAAGTGAATTTAAAGACCGGACTAAACGTGTAGTGCTAACGGCAGAGGAATTTCGGACGGGGGTTCAACTCCCCCCAGCTCCACCAAATAACAATCCAAAGCAAACTTATCAAATCCCAAAAGCCCTTGAAAATATTAACCTCAAGGGCTTTTTTATATCCTAAGCGTTCCTACCCAATCCTATAAAATCCTTGAATTTTAGTTATACGTTTAGTTATACTGATAGCCGTATAACAAAATCGGTATAACTAAAACCATACAAAACCTGTTAGCAAAAGGTTTTGCTCATGTTTTAGCTATATCCAAATTTTTAAAAGTCTGAATCTCCGTCGGAGTTATTTAGAACAGTTTTCAACTCTCAGAAAGAAGCAATATGGCACGCACAA > 1/428789‑429270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |