| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 387,111 | G→A | intergenic (‑42188/+24765) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 387,111 | 0 | G | A | 100.0% | 157.8 / NA | 56 | intergenic (‑42188/+24765) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/24); total (32/24) | |||||||||||
AAAACGAAGTGCCGCAATGGGATTTAACACCGATAGATCCTTCAAGTTTGGTTCAGCGTTCAAAAAGCCATTTAGTGAAAGTGGAATTTTCGGATGATCGACATACCTTAAATTTACAATACCGAACGCTTGATAATCATATCGGTAGTCGAAAAATTGAGAATCAGAATTATCAGTTAAATTACAATTTTAATAATAATGGCTATCTTGATCTCAATGTATTGCTGGCGCATAACGTAGGCAAACAAAAGTATCCGAGCGGTTCACGTTTTGGCGGCTGGCAGGTATTGAAATATTTGGAAACCAAAAATACAGCGGATATTGTTGATATTAGTAACAGTTATACCTTTTCGCTGCCAAAAGAAACCGATCTAAAAACGACCTTAGGCGTGAATTTATTTAAAAATCAATATACTAAAAATCGTTTCCCGGAAGAACTCAGTCCTTTTTACGACGGTCCTTCGCAAAAAAGCGGACTATATGA > 1/386871‑387354 | aaaaCGAAGTGCCGCAATGGGATTTAACACCGATAGATCCTTCAAGTTTGGTTCAGCGTTCAAAAAGCCATTTAGTGAAAGTGGAATTTTCGGATGATCGACATACCTTAAATTTACAATACCGAACGCTTGATAATCATATCGGTAGTCGAAAAATTGAGAATCAGAATTATCAGTTAAATTACAATTTTAATAATAATGGCTATCTTGATCTCAATGTATTGCTGGCGCATAACGTAGACAAACAAAAg < 1:292723/251‑1 (MQ=255) 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AAAACGAAGTGCCGCAATGGGATTTAACACCGATAGATCCTTCAAGTTTGGTTCAGCGTTCAAAAAGCCATTTAGTGAAAGTGGAATTTTCGGATGATCGACATACCTTAAATTTACAATACCGAACGCTTGATAATCATATCGGTAGTCGAAAAATTGAGAATCAGAATTATCAGTTAAATTACAATTTTAATAATAATGGCTATCTTGATCTCAATGTATTGCTGGCGCATAACGTAGGCAAACAAAAGTATCCGAGCGGTTCACGTTTTGGCGGCTGGCAGGTATTGAAATATTTGGAAACCAAAAATACAGCGGATATTGTTGATATTAGTAACAGTTATACCTTTTCGCTGCCAAAAGAAACCGATCTAAAAACGACCTTAGGCGTGAATTTATTTAAAAATCAATATACTAAAAATCGTTTCCCGGAAGAACTCAGTCCTTTTTACGACGGTCCTTCGCAAAAAAGCGGACTATATGA > 1/386871‑387354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |