| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,106,161 | T→G | intergenic (‑50278/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,106,161 | 0 | T | G | 100.0% | 253.7 / NA | 88 | intergenic (‑50278/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (48/40); total (48/40) | |||||||||||
AATGCCTTCAATGCGCAAAATCCGCTTTAACAGCAAATCCAGCACAACCTGCCCGCCGTGTCCTTGAAGTTCCAGCACATCTTCGCCGGTAAAGGAATTCGGTCCTTTAAAATACAGTGCAATGCCCTGATCCAAAACGGTTCCGTCCGCCTCTTTAAAAGGCAAATAATCCGCCATACGCGGTTTCGGGCATTTCCCCAACACCGCTTGCGCCACCTCAATGGCTTTATGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTTCTCTAAACCA > 1/2105932‑2106404 | aaTGCCTTCAATGCGCAAAATCCGCTTTAACAGCAAATCCAGCACAACCTGCCCGCCGTGTCCTTGAAGTTCCAGCACATCCTCGCCGGTAAAGGAATTCGGTCCTTTAAAATACAGTGCAATGCCCTGATCCAAAACGGTTCCGTCCGCCTCTTTAAAAGGCAAATAATCCGCCATACGCGGTTTCGGGCATTTCCCCAACACCGCTTGCGCCACCTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATg > 1:231161/1‑250 (MQ=255) 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ccccAACACCGCTTGCGCCACCTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACgg > 1:396020/1‑251 (MQ=255) acacCGCTTGCGCCACCTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTg < 1:619830/224‑1 (MQ=255) cccGCTTGCGCCACCTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTa < 1:115812/250‑1 (MQ=255) cTTGCGCCACCTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAAccc < 1:166406/251‑1 (MQ=255) cgcCACCTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCtttt > 1:229410/1‑251 (MQ=255) cACCTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTtc < 1:139768/251‑1 (MQ=255) ccTCAATGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAg < 1:711665/91‑1 (MQ=255) 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1:767675/1‑237 (MQ=255) aTGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTTCTCTAAAc < 1:296586/251‑1 (MQ=255) aTGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTTCTCTAAAc < 1:573872/251‑1 (MQ=255) tGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTTCTCTAAAcc < 1:231995/251‑1 (MQ=255) tGGCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTTCTCTAAAcc < 1:132860/251‑1 (MQ=255) gCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTc < 1:207915/85‑1 (MQ=255) gCTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTTCTCTAAACCa > 1:322665/1‑250 (MQ=255) gtttAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCGTTTAATGCGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGAt > 1:611242/2‑193 (MQ=255) cTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAAc > 1:34009/1‑96 (MQ=255) cTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAg > 1:228419/1‑170 (MQ=255) cTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGc < 1:565573/184‑1 (MQ=255) cTTTAGGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAgg > 1:487912/1‑196 (MQ=255) | AATGCCTTCAATGCGCAAAATCCGCTTTAACAGCAAATCCAGCACAACCTGCCCGCCGTGTCCTTGAAGTTCCAGCACATCTTCGCCGGTAAAGGAATTCGGTCCTTTAAAATACAGTGCAATGCCCTGATCCAAAACGGTTCCGTCCGCCTCTTTAAAAGGCAAATAATCCGCCATACGCGGTTTCGGGCATTTCCCCAACACCGCTTGCGCCACCTCAATGGCTTTATGACCGGATACACGCAAAATGCCGATTCCGCCGCGCCCCGGGGCTGTGGCTTGTGCTACGATTGTTTCTTTCATAAGTCTATTCTCAAAACATTGGATTTTGTGACCGCACTTTTTCCTTTAAAGTGTGGTCATTTTTTGATGCGTTTTTTAACTAAAATAAAAGGCACCGATACGTGCCTTTTCGATAGGAGTGATTCAACTATTTTTTATGACGGGTATGTAACCCTTTTTTCTCTAAACCA > 1/2105932‑2106404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |