| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,080,789 | G→T | intergenic (‑24906/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,080,789 | 0 | G | T | 100.0% | 208.3 / NA | 77 | intergenic (‑24906/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (34/43); total (34/43) | |||||||||||
CGTGAACTTACCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTGGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCGCACTTGAAACAAGAAGAAGATTTCCC > 1/2080544‑2081031 | cgtgAACTTACCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGttgtgg < 1:774334/250‑1 (MQ=255) tgAACTTACCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTa < 1:873705/250‑1 (MQ=255) tgAACTTACCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTAt < 1:497480/251‑1 (MQ=255) ttACCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGaa < 1:636490/251‑1 (MQ=255) aCCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAgg < 1:123645/251‑1 (MQ=255) aCCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAgg < 1:428961/251‑1 (MQ=255) ccggcAAACACGGCATTCAAGTGTTCTTCGATGCAACCCGTTGCGCTGAGAATGCTTACATCATTAATGAACATGAAGACGTCTACCAGGGGAGGTCCATTAGGGCCAGCATTCACGAGATGTCCAGCTATGCCGACGGATGTACCATGAGCGCTAGAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGAGGCTTCTTATGGAGGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAGAGAGTTAGTTGTGGTATTTGagggg < 1:190403/247‑5 (MQ=255) acacGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGt < 1:537003/251‑1 (MQ=255) gCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTa > 1:740042/1‑250 (MQ=255) aTTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg < 1:77998/251‑1 (MQ=255) aTTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg < 1:407715/251‑1 (MQ=255) aTTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg < 1:88726/251‑1 (MQ=255) aTTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg > 1:700244/1‑251 (MQ=255) aTTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCGCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg < 1:435731/251‑1 (MQ=255) gtgtTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTAt > 1:686869/1‑251 (MQ=255) cttcGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTg < 1:146923/251‑1 (MQ=255) aTGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCg < 1:665986/250‑1 (MQ=255) aTGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGt > 1:355820/1‑251 (MQ=255) cccGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGata > 1:797679/1‑249 (MQ=255) ttgcgttgAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAg < 1:631244/251‑1 (MQ=255) aCAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGaa > 1:585983/1‑178 (MQ=255) ggAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGGCGCGATATGGAAGCCATGGCAATCGGCTTGAAAGAAGCCACCCaaa > 1:653569/1‑250 (MQ=255) gCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAAt < 1:720787/249‑1 (MQ=255) cTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACa > 1:694853/1‑251 (MQ=255) aTCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAacac < 1:631071/251‑1 (MQ=255) aTCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAac < 1:17275/249‑1 (MQ=255) aTCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAac < 1:399386/249‑1 (MQ=255) gCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg < 1:180212/172‑1 (MQ=255) ccATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg < 1:118901/169‑1 (MQ=255) ccATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGGCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCCAGAAGAATACATTGAACACCGTGTa > 1:263809/1‑251 (MQ=255) cATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGGGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAAAAGCCACCCAAGAAGGATACATTGAACAACGTGTaa > 1:620057/1‑251 (MQ=255) atTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAac < 1:671607/229‑1 (MQ=255) aTGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGGTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGa > 1:336248/1‑251 (MQ=255) gCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGTGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAAc < 1:425711/225‑1 (MQ=255) gCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAaag < 1:28808/181‑1 (MQ=255) gCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGa < 1:601143/206‑1 (MQ=255) gCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAAc < 1:55076/220‑1 (MQ=255) cGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGccgccg > 1:222404/1‑251 (MQ=255) cGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGGCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGGTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAAAACCGTGTAAAAc > 1:751192/1‑215 (MQ=255) gCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAac < 1:834056/201‑1 (MQ=255) gCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCgg > 1:483218/1‑250 (MQ=255) gCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGGCGTGATATGGAAGcc > 1:14225/1‑155 (MQ=255) gTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAacac > 1:842439/1‑200 (MQ=255) gTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAac > 1:829169/1‑198 (MQ=255) aCCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTTAACACCGTGTAAAACAAGAGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCggac > 1:817168/1‑247 (MQ=255) aCCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTAc > 1:29514/1‑250 (MQ=255) ccATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCg < 1:737190/251‑1 (MQ=255) cGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGAttgttg > 1:444903/1‑251 (MQ=255) gTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAaca < 1:868732/187‑1 (MQ=255) gTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGaa > 1:157193/1‑251 (MQ=255) gTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGGATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTAtc < 1:453710/210‑1 (MQ=255) aCTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATtgg < 1:326250/250‑1 (MQ=255) cTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAacac > 1:768595/1‑178 (MQ=255) cTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGCTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCCTGCCAATCGGTTTTAAAGAATCCACCCAAGAAGAATACATTGAAAACCGGGTAAAACAAGTGCGCTATCTTGGCGAAAAATTTAAAGCCGCCCGCGTACCGATTGCTGAACCGATtggtg > 1:850691/1‑251 (MQ=255) gCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCaagaag < 1:716795/162‑1 (MQ=255) gCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATtggtggg > 1:54226/1‑250 (MQ=255) cTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTggtggt < 1:163990/250‑1 (MQ=255) aCCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATg > 1:734859/1‑250 (MQ=255) gcTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGa < 1:358308/250‑1 (MQ=255) gcTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGa < 1:399640/250‑1 (MQ=255) cttcttATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGGATTCTTGGATg > 1:365999/1‑251 (MQ=255) cttcttATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGGCGTGATATGGAAGCCATTGGAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGGTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATTCCGTATTCtctgtc > 1:597182/1‑245 (MQ=255) tcttATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAAc < 1:16357/165‑1 (MQ=255) tgtatgAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAac < 1:894892/148‑1 (MQ=255) tgtatgAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCcgtcg > 1:180399/1‑251 (MQ=255) tgtatgAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCcggcg > 1:489757/1‑248 (MQ=255) gtatgAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTAcgg < 1:548424/73‑1 (MQ=255) gtatgAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGCAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGCGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTTAACCGATTGGGGGTCATGCCGTATTCTTg > 1:897040/1‑239 (MQ=255) cGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGc > 1:681810/1‑250 (MQ=255) aTGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCCAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGCTTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGGTGCCCGTCGTTTCTGccc > 1:411198/1‑250 (MQ=255) aTGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAAAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCg > 1:572272/1‑251 (MQ=255) aTGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAACCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGGGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGGATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCg > 1:862541/1‑251 (MQ=255) ttGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGa < 1:291732/80‑1 (MQ=255) gTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCgtgt < 1:248030/135‑1 (MQ=255) ttCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCGCACTTGAAAc < 1:783385/250‑1 (MQ=255) ttCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCGCACTTGAAACa < 1:375911/251‑1 (MQ=255) ttCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCGCACTTGAAACa < 1:490635/251‑1 (MQ=255) aaGCCAAAGAGTTAGTTGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTGCTGCCCGCACTTGAAACaagaagaa < 1:838293/251‑1 (MQ=255) agttagttGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCGCACTTGAAACAAGAAGAAGATTTccc < 1:425522/250‑1 (MQ=255) agttagttGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCGCACTTGAAACAAGAAGAAGATTTccc < 1:579743/250‑1 (MQ=255) | CGTGAACTTACCGCCAAACACGGCATTAAAGTGTTCTTCGATGCCACCCGTTGCGTTGAAAATGCTTACTTCATTAAAGAACAGGAAGAAGGCTACCAAGATCGCTCCATTAAATCCATCATTCACGAAATGTTCAGCTATGCCGACGGCTGTACCATGAGCGGTAAAAAAGACTGCTTAACCAATATCGGCGGCTTCTTATGTATGAACGATGAAGAATTGTTCATGAAAGCCAAAGAGTTAGTGGTGGTATTTGAAGGTATGCCGTCTTACGGCGGTATGGCTGGTCGTGATATGGAAGCCATGGCAATCGGTTTGAAAGAAGCCACCCAAGAAGAATACATTGAACACCGTGTAAAACAAGTGCGTTATCTCGGCGAAAAATTAAAAGCCGCCGGCGTACCGATTGTTGAACCGATTGGTGGTCATGCCGTATTCTTGGATGCCCGTCGTTTCTGCCCGCACTTGAAACAAGAAGAAGATTTCCC > 1/2080544‑2081031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |