| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,077,150 | A→G | intergenic (‑21267/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,077,150 | 0 | A | G | 100.0% | 201.9 / NA | 73 | intergenic (‑21267/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (29/44); total (29/44) | |||||||||||
TTCCTGATGTTGACGCGGTTTGACGGCTTCTTGCGCTTTTGCAGGCTCACTC‑GGTTTAATGGTTTCGACCTCTTCCGGTTTGACTTCTGCCGGTTTATTTTCTACCGCCGCAGTTGTCGTTTGCTCAGCAACGGAGGTGGTTGCCCCTTGTTCCACCGCTTGCGGTTCTATGGCGCCGGCATTGACATTTTGCGTATTGGTTTCCGCAGCAGGTTGTTGCGCGACAGTGTTATCGGTTTGCGAGGTCAGATTATCCAACACGGTCGGTTCAACGGTTTGTGATTGGTCTAACTGCTGGAATTGAATCGGCACGCCGTTATTACTTTGCTGCTCGTAAGATTGCACCGTATCGGAGCTTGGTTTCATCCACAAGATAAAAATCAGCACCAACACCACGCCGAATAGCGCGACGAAAATGCGACGATGTTTTTGCGGGAGAATACTTAAAATCGCCCAATTTTCAGGATTTTTAAAACCGGCTTTCGG > 1/2076908‑2077393 | ttCCTGATGTTGACGCGGTTTGACGGCTTCTTGCGCTTTTGCAGGCTCACTC‑GGTTTAACGGTTTCGACCTCTTCCGGTTTGACTTCTGCCGGTTTATTTTCTACCGCCGCAGTTGTCGTTTGCTCAGCAACGGAGGTGGTTGCCCCTTGTTCCACCGCTTGCGGTTCTATGGCGCCGGCATTGACATTTTGCGTATTGGTTTCCGCAGCAGGTTGTTGCGCGACAGTGTTATCGGTTTGCGGGGTCAGAt > 1:616159/1‑251 (MQ=255)ttCCTGATGTTGACGCGGTTTGACGGCTTCTTGCGCTTTTGCAGGCTCACTC‑GGTTTAACGGTTTCGACCTCTTCCGGTTTGACTTCTGCCGGTTTATTTTCTACCGCCGCAGTTGTCGTTTGCTCAGCAACGGAGGTGGTTGCCCCTTGTTCCACCGCTTGCGGTTCTATGGCGCCGGCATTGACATTTTGCGTATTGGTTTCCGCAGCAGGTTGTTGCGCGACAGTGTTATCGGTTTGCGGGGTCAGAt > 1:762059/1‑251 (MQ=255)ttCCTGATGTTGACGCGGTTTGACGGCTTCTTGCGCTTTTGCAGGCTCACTC‑GGTTTAACGGTTTCGACCTCTTCCGGTTTGACTTCTGCCGGTTTATTTTCTACCGCCGCAGTTGTCGTTTGCTCAGCAACGGAGGTGGTTGCCCCTTGTTCCACCGCTTGCGGTTCTATGGCGCCGGCATTGACATTTTGCGTATTGGTTTCCGCAGCAGGTTGTTGCGCGACAGTGTTATCGGTTTGCGGGGTCAGAt < 1:177316/251‑1 (MQ=255) aTGTTGACGCGGTTTGACGGCTTCTTGCGCTTTTGCAGGCTCACTC‑GGTTTAACGGTTTCGACCTCTTCCGGTTTGACTTCTGCCGGTTTATTTTCTACCGCCGCAGTTGTCGTTTGCTCAGCAACGGAGGTGGTTGCCCCTTGTTCCACCGCTTGCGGTTCTATGGCGCCGGCATTGACATTTTGCGTATTGGTTTCCGCAGCAGGTTGTTGCGCGACAGTGTTATCGGTTTGCGGGGTCAGATTATcc < 1:321196/250‑1 (MQ=255) 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TTCCTGATGTTGACGCGGTTTGACGGCTTCTTGCGCTTTTGCAGGCTCACTC‑GGTTTAATGGTTTCGACCTCTTCCGGTTTGACTTCTGCCGGTTTATTTTCTACCGCCGCAGTTGTCGTTTGCTCAGCAACGGAGGTGGTTGCCCCTTGTTCCACCGCTTGCGGTTCTATGGCGCCGGCATTGACATTTTGCGTATTGGTTTCCGCAGCAGGTTGTTGCGCGACAGTGTTATCGGTTTGCGAGGTCAGATTATCCAACACGGTCGGTTCAACGGTTTGTGATTGGTCTAACTGCTGGAATTGAATCGGCACGCCGTTATTACTTTGCTGCTCGTAAGATTGCACCGTATCGGAGCTTGGTTTCATCCACAAGATAAAAATCAGCACCAACACCACGCCGAATAGCGCGACGAAAATGCGACGATGTTTTTGCGGGAGAATACTTAAAATCGCCCAATTTTCAGGATTTTTAAAACCGGCTTTCGG > 1/2076908‑2077393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |