| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 2,056,438 | A→G | intergenic (‑555/–) | unknown ← / – | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,056,438 | 0 | A | G | 100.0% | 192.3 / NA | 68 | intergenic (‑555/–) | unknown/– | tRNA‑Met‑CAT/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (40/28); total (40/28) | |||||||||||
TTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCGGTGGTAAATCAGGGTGATTTTTTAACCCAACTGTCAAATATAAATAATTATTCCGCTAAATTGAGCAGCAGCTTCGCCCCGCTTTACAACAAAGTAACCGCTTGGGTACTCGCCGGTGCCAATACCGGTGAATTAACTAATTTCGGTATCCAAAGCCAAGTGATGAAAGGCTTCGACGGCTATCAAAATGTACTCATGACGGGCTATTATTCCCCGGTGATTCATGCCCGTCGCACCCAACAAGGCAAATTTAACCAACCGATTTATGCACTTCCTTCGAAAAAACGTTTCTCCCGTGCCGAAATTTATGCCGGTGCATTGAGAGGTAAAGGTTTGGAATTG > 1/2056201‑2056684 | ttCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCGGTGGTAAATCAGGGTGATTTTTTAACCCAACTGTCAAATATAAATAATTATTCCGCTAAATTGAGCAGCAGCTTCGCCCCGCTTTACAACAAAGTGACCGCTTGGGTAc < 1:885291/251‑1 (MQ=255) 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acaaAGTGACCGCTTGGGTACTCGCCGGTGCCAATACCGGTGAATTAACTAATTTCGGTATCCAAAGCCAAGTGATGAAAGGCTTCGACGGCTATCAAAATGTACTCATGACGGGCTATTATTCCCCGGTGATTCATGCCCGTCGCACCCAACAAGGCAAATTTAACCAGCCGATTTATGCACTTCCTTCGAAAAAACGTTTCTCCCGTGCCGAAATTTATGCCGGTGCATTGAGAGGTAAAGGTTTGGaa < 1:47520/251‑1 (MQ=255) acaaAGTGACCGCTTGGGTACTCGCCGGTGCCAATACCGGTGAATTAACTAATTTCGGTATCCAAAGCCAAGTGATGAAAGGCTTCGACGGCTATCAAAATGTACTCATGACGGGCTATTATTCCCCGGTGATTCATGCCCGTCGCACCCAACAAGGCAAATTTAACCAACCGATTTATGCACTTCCTTCGAAAAAACGTTTCTCCCGTGCCGAAATTTATGCCGGTGCATTGAGAGGTAAAGGTTTGGaa < 1:400247/251‑1 (MQ=255) acaaAGTGACCGCTTGGGTACTCGCCGGTGCCAATACCGGTGAATTAACTAATTTCGGTATCCAAAGCCAAGTGATGAAAGGCTTCGACGGCTATCAAAATGTACTCATGACGGGCTATTATTCCCCGGTGATTCATGCCCGTCGCACCCAACAAGGCAAATTTAACCAACCGATTTATGCACTTCCTTCGAAAAAACGTTTCTCCCGTGCCGAAATTTATGCCGGTGCATTGAGAGGTAAAGGTTTGGaa < 1:895915/251‑1 (MQ=255) aaGTGACCGCTTGGGTACTCGCCGGTGCCAATACCGGTGAATTAACTAATTTCGGTATCCAAAGCCAAGTGATGAAAGGCTTCGACGGCTATCAAAATGTACTCATGACGGGCTATTATTCCCCGGTGATTCATGCCCGTCGCACCCAACAAGGCAAATTTAACCAACCAATTTATGCACTTCCTTCGAAAAAACGTTTCTCCCGTGCCGAAATTTATGCCGGTGCATTGAGAGGTAAAGGTTTGGAATTg > 1:435340/1‑251 (MQ=255) | TTCTAATAAACCTGCAGCCGGACAAACAACAGCCCAAAATACATTGGACATCGATCCGCAAAAATTCGGCGCAATTTATAACGGACGGACTTATCAGCAATCCATTTTTATGCCGGTGAGCCAAATTGAAAACAAAAGTGCGGTGGTAAATCAGGGTGATTTTTTAACCCAACTGTCAAATATAAATAATTATTCCGCTAAATTGAGCAGCAGCTTCGCCCCGCTTTACAACAAAGTAACCGCTTGGGTACTCGCCGGTGCCAATACCGGTGAATTAACTAATTTCGGTATCCAAAGCCAAGTGATGAAAGGCTTCGACGGCTATCAAAATGTACTCATGACGGGCTATTATTCCCCGGTGATTCATGCCCGTCGCACCCAACAAGGCAAATTTAACCAACCGATTTATGCACTTCCTTCGAAAAAACGTTTCTCCCGTGCCGAAATTTATGCCGGTGCATTGAGAGGTAAAGGTTTGGAATTG > 1/2056201‑2056684 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |