| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 2,039,585 | T→C | intergenic (‑46877/+1092) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,039,585 | 0 | T | C | 100.0% | 260.8 / NA | 91 | intergenic (‑46877/+1092) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (54/37); total (54/37) | |||||||||||
GATGCTTGCCTTACCGGTCTTTCTACTTTCCCGCGTTCTTCCGTTGGACTGGGAACCGCGTTTATGGGCGCTGCTTGGCGTCAGCTTCTTTATTTGGCTCGCCACTCAAATGCACACCAACGGTATTGGCTTACTGTTCCGTATTCTTTTTCTGATTGCCGCCATCACACTAGCCCAGCCGCTCCAAAATTGGCTGTGGCAAAATAATACCGACCATGCAAGAACCCATAGTGCGGTCAAGAATTCTCTTGAATTTCAATCCGTGCAAAGCTACGAGGAGTTACAACTGGTATTAACGAAGAACCCGAAACCACTGGCGCTATTGGATCTTTACGCGGATTGGTGCGTCGCTTGTAAAGAATTTGAACATAAAACCTTTGCGGAACCACAAGTGCAAGACGCTTTAAAAGACGTTTTGCTGTTAAGAATCGACATGACAAACAACAGCGAAAACAACCGCACTTTAATGAAGCAATTGTCAATAACCGGC > 1/2039339‑2039828 | gATGCTTGCCTTACCGGTCTTTCTACTTTCCCGCGTTCTTCCGTTGGACTGGGAACCGCGTTTATGGGCGCTGCTTGGCGTCAGCTTCTTTATTTGGCTCGCCACTCAAATGCACACCAACGGTATTGGCTTACTGTTCCGTATTCTTTTTCTGATTGCCGCCATCACACTAGCCCAGCCGCTCCAAAATTGGCTGTGGCAAAATAATACCGACCATGCAAGAACCCATAGTGCGGTCAAGAATTCCCTTg > 1:220123/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |