| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,010,509 | A→G | intergenic (‑17801/+30168) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,010,509 | 0 | A | G | 100.0% | 191.3 / NA | 70 | intergenic (‑17801/+30168) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (34/36); total (34/36) | |||||||||||
GCAACATCCCGGTGGAAATTTTATGTGATGACATTCGTCATATTGGGATCAAAAACGCATCCATGGTGATTTTAAATTTCACCCTGCAATTTTTACTGCCGCAGGATCGCATTGCGTTACTGGAGAAAATTTATCAAGGATTAAATCCCAATGGCGTGTTGGTGCTATCGGAAAAATTCCGTTTTGAAGATGGGAAAATTGACGAATTGCTGATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACAGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGTTCCAGTGCTTTAATTTCGGTTCGATGATCGCCATCAAATAATGCGTTCTTCCAAGAGAAAAGTGCGGTGGATTTAAAAAACATTTTAAAAATCCACCGCACTTTTTGTTGAACGCCTTTT > 1/2010264‑2010752 | gCAACATCCCGGTGGAAATTTTATGTGATGACATTCGTCATATTGGGATCAAAAACGCATCCATGGTGATTTTAAATTTCACCCTGCAATTTTTACTGCCGCAGGATCGCATTGCGTTACTGGAGAAAATTTATCAAGGATTAAATCCCAATGGCGTGTTGGTGCTATCGGAAAAATTCCGTTTTGAAGATGGGAAAATTGACGAATTGCTGATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTa > 1:687593/1‑250 (MQ=255) 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aTCGGAAAAATTCCGTTTTGAAGATGGGAAAATTGACGAATTGCTGATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTccc > 1:385591/1‑188 (MQ=255) aTTCCGTTTTGAAGATGGGAAAATTGACGAATTGCTGATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGTTCCAGTGCTTTAATTTCGGTTCGATGATCGCCATCAAATAATGCGTTCTTCCAagag < 1:753882/251‑1 (MQ=255) gggAAAATTGACGAATTGCTGATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGCTcc > 1:725831/1‑181 (MQ=255) cTGATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGTTCCAGTGCTTTAATTTCGGTTCGATGATCGCCATCAAATAATGCGTTCTTCCAAGAGAAAAGTGCGGTgg < 1:635321/230‑1 (MQ=255) gATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGTTCCAGTGCTTTAATTTCGGTTCGATGATCGCCATCAAATAATGCGTTCTTCCAAGAGaaa < 1:591218/218‑1 (MQ=255) gACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGaa > 1:501772/1‑75 (MQ=255) gCACCACCAATTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCAc < 1:518543/60‑1 (MQ=255) aTTCAAACGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGTTCCAGTGCTTTAATTTCGGTTCGATGATCGCCATCAAATAATGCGTTCTTCCAAGAGAAAAGTGCGGTGGATTTAAAAAACATTTTAAAAATCCACCGCACTTTTTGTTGa > 1:621121/1‑251 (MQ=255) cGTGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGa < 1:758677/80‑1 (MQ=255) tGCCAACGGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGTTCCAGTGCTTTAATTTCGGTTCGATGATCGCCATCAAATAATGCGTTCTTCCAAGAGAAAAGTGCGGTGGATTTAAAAAACATTTTAAAAATCCACCGCACTTTTTGTTGAACGCCtttt > 1:648114/1‑251 (MQ=255) | GCAACATCCCGGTGGAAATTTTATGTGATGACATTCGTCATATTGGGATCAAAAACGCATCCATGGTGATTTTAAATTTCACCCTGCAATTTTTACTGCCGCAGGATCGCATTGCGTTACTGGAGAAAATTTATCAAGGATTAAATCCCAATGGCGTGTTGGTGCTATCGGAAAAATTCCGTTTTGAAGATGGGAAAATTGACGAATTGCTGATCGACCTGCACCACCAATTCAAACGTGCCAACAGCTACAGTGAATTAGAAGTGAGCCAGAAACGCACTGCCTTGGAAAAGGTTATGCGTACGGACAGTATTGAAACCCATAAAGTGCGGTTAAAAAATGTGGGATTTTCCCATGTGGAACTGTGGTTCCAGTGCTTTAATTTCGGTTCGATGATCGCCATCAAATAATGCGTTCTTCCAAGAGAAAAGTGCGGTGGATTTAAAAAACATTTTAAAAATCCACCGCACTTTTTGTTGAACGCCTTTT > 1/2010264‑2010752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |