| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,000,934 | G→A | intergenic (‑8226/+39743) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,000,934 | 0 | G | A | 100.0% | 118.1 / NA | 42 | intergenic (‑8226/+39743) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (21/21); total (21/21) | |||||||||||
CATGATAGCCAACAGAAAAGTCATCCCTAACGTTAATGGCACAAATATGAAGTGATATAATGCAGTCAAAGCAAACTGCAGTCTTGAGAGTTCAACAACGTCTAACATCTCGACTCCTTGTAAATGCTACAAGTCCTTAAATTATGATTACTTCGTAATCACCCCAGAAACTCAAAAATCTTTGAATCTTTAATTTAGGATTACCTTATTATAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGGGTCGATTATTACATAGATAATCCAAACAGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGATATAAATCAAAAATAATCAAACATAGGTGTTTTTTACTATTTTGCTCAAGATCAAATTATAAATTTCAATAACATCTTTGCAACACAAAGCATAGCGCCCTTGACCCGGTATGATTC > 1/2000697‑2001150 | cATGATAGCCAACAGAAAAGTCATCCCTAACGTTAATGGCACAAATATGAAGTGATATAATGCAGTCAAAGCAAACTGCAGTCTTGAGAGTTCAACAACGTCTAACATCTCGACTCCTTGTAAATGCTACAAGTCCTTAAATTATGATTACTTCGTAATCACCCCAGAAACTCAAAAATCTTTGAATCTTTAATTTAGGATTACCTTATTATAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGAGTCGATTATTACa > 1:223282/1‑251 (MQ=255) 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tCTTGAGAGTTCAACAACGTCTAACATCTCGACTCCTTGTAAATGCTACAAGTCCTTAAATTATGATTACTTCGTAATCACCCCAGAAACTCAAAAATCTTTGAATCTTTAATTTAGGATTACCTTATTATAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGAGTCGATTATTACATAGATAATCCAAACAGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACAt < 1:453818/249‑1 (MQ=255) gTTCAACAACGTCTAACATCTCGACTCCTTGTAAATGCTACAAGTCCTTAAATTATGATTACTTCGTAATCACCCCAGAAACTCAAAAATCTTTGAATCTTTAATTTAGGATTACCTTATTATAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGAGTCGATTATTACATAGATAATCCAAACAGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGatat > 1:153562/1‑251 (MQ=255) acaacGTCTAACATCTCGACTCCTTGTAAATGCTACAAGTCCTTAAATTATGATTACTTCGTAATCACCCCAGAAACTCAAAAATCTTTGAATCTTTAATTTAGGATTACCTTATTATAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGAGTCGATTATTACATAGATAATCCAAACAGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGa > 1:568381/1‑243 (MQ=255) tctcGACTCCTTGTAAATGCTACAAGTCCTTAAATTATGATTACTTCGTAATCACCCCAGAAACTCAAAAATCTTTGAATCTTTAATTTAGGATTACCTTATTATAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGAGTCGATTATTACAt < 1:38124/145‑1 (MQ=255) 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attatAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGAGTCGATTATTACATAGATAATCCAAACAGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGATATAAATCAAAAATAATCAAACATAGGTGTTTTTTACTATTTTGCTCAAGATCAAATTATAAATTTCAATAACATCTTTGCAACACAAAGCATAGCGCCCTTGACCCGGTATGATTc > 1:71755/1‑247 (MQ=255) | CATGATAGCCAACAGAAAAGTCATCCCTAACGTTAATGGCACAAATATGAAGTGATATAATGCAGTCAAAGCAAACTGCAGTCTTGAGAGTTCAACAACGTCTAACATCTCGACTCCTTGTAAATGCTACAAGTCCTTAAATTATGATTACTTCGTAATCACCCCAGAAACTCAAAAATCTTTGAATCTTTAATTTAGGATTACCTTATTATAATGACTGCCACTTGCAGTTGTCGGGGTCGATTATTACATAGATAATCCAAACAGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGATATAAATCAAAAATAATCAAACATAGGTGTTTTTTACTATTTTGCTCAAGATCAAATTATAAATTTCAATAACATCTTTGCAACACAAAGCATAGCGCCCTTGACCCGGTATGATTC > 1/2000697‑2001150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |