| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,995,937 | C→T | intergenic (‑3229/+44740) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,995,937 | 0 | C | T | 100.0% | 165.2 / NA | 61 | intergenic (‑3229/+44740) | unknown/unknown | tRNA‑Lys‑TTT/tRNA‑Ser‑TGA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (26/35); total (26/35) | |||||||||||
TGTTTCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTCACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTGCCGCCGATTGAAATGGCGTACTGACCGATTCCCGACACTTCTAAAA > 1/1995690‑1996183 | tGTTTCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTAcc < 1:601727/251‑1 (MQ=255)tGTTTCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATGCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTACATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCGTATTCTGCACAATGTTAcc < 1:612679/251‑1 (MQ=255) ttttCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCt < 1:473357/250‑1 (MQ=255) tttCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCt < 1:267051/250‑1 (MQ=255) tttCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCt < 1:687060/250‑1 (MQ=255) tttCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCt < 1:819874/250‑1 (MQ=255) tCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCt < 1:665637/248‑1 (MQ=255) tgAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGAtt < 1:392225/251‑1 (MQ=255) aaCCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATg < 1:602484/251‑1 (MQ=255) aCCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGa < 1:122392/251‑1 (MQ=255) aTAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAATAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGt < 1:449691/250‑1 (MQ=255) tAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTa > 1:51211/1‑250 (MQ=255) tCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTActtctt < 1:208119/251‑1 (MQ=255) ccGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATg < 1:859060/193‑1 (MQ=255) ccGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTATCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCAt > 1:430891/1‑236 (MQ=255) gTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTggg > 1:653464/1‑164 (MQ=255) gCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCAccgccg > 1:506109/1‑251 (MQ=255) ccgccCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCCCCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTATGTCATTAAACCAACGTATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAAc < 1:74479/250‑1 (MQ=255) ccgccCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAAc < 1:840209/250‑1 (MQ=255) tGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGc > 1:724132/1‑224 (MQ=255) gTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTg < 1:310301/185‑1 (MQ=255) tCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTa < 1:381199/250‑1 (MQ=255) tCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTa < 1:445127/250‑1 (MQ=255) cAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTAcc < 1:894388/118‑1 (MQ=255) atatTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCAccgc < 1:499889/224‑1 (MQ=255) atatTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCtt > 1:298722/1‑251 (MQ=255) tattatGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGAttt > 1:310849/1‑155 (MQ=255) tattatGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATg > 1:744945/1‑192 (MQ=255) tattatGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCttt < 1:832002/251‑1 (MQ=255) attatGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACattgtattgt > 1:482579/1‑243 (MQ=255) ttatGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATg > 1:567842/1‑157 (MQ=255) atGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCAc < 1:891775/216‑1 (MQ=255) atGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGACGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCa > 1:811323/1‑251 (MQ=255) tGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGt < 1:86987/202‑1 (MQ=255) tGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCaa > 1:477554/1‑251 (MQ=255) gcTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAgg < 1:300742/190‑1 (MQ=255) ttAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTg < 1:316492/251‑1 (MQ=255) cAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAgg < 1:510061/178‑1 (MQ=255) gAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCt < 1:638265/82‑1 (MQ=255) acGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCAt < 1:857130/163‑1 (MQ=255) aaGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATttaatta > 1:449168/1‑81 (MQ=255) gTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCt > 1:21974/1‑70 (MQ=255) gCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTggg > 1:99628/1‑229 (MQ=255) atgGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATTAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTAc < 1:578640/251‑1 (MQ=255) atgGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGAttt > 1:683320/1‑244 (MQ=255) aaTCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGAt > 1:580076/1‑108 (MQ=255) aaTCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACattgtattg > 1:850280/1‑182 (MQ=255) cacaACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTgccg > 1:497583/1‑251 (MQ=255) acaACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTgccgc < 1:364393/251‑1 (MQ=255) caACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCttt > 1:491/1‑185 (MQ=255) cAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTGCCGCCGATTGAAAt < 1:826549/251‑1 (MQ=255) aaCATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTActtct > 1:567196/1‑137 (MQ=255) gTCGCTTATTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTGCCGCCGATTGAAATGGCGTACTGACCGAt > 1:333448/1‑251 (MQ=255) aTTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAg < 1:685097/108‑1 (MQ=255) aTTCTGCACAATGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTg < 1:326928/178‑1 (MQ=255) aTGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAg > 1:33349/1‑98 (MQ=255) aTGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACattgtattgt < 1:327225/137‑1 (MQ=255) aTGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCAt > 1:211075/1‑177 (MQ=255) aTGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTGCCGCCGATTGAAATGGCGTACTGACCGATTCCCGACACTTCTaaaa < 1:355341/251‑1 (MQ=255) aTGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTGCCGCCGATTGAAATGGCGTACTGACCGATTCCCGACACTTCTaaaa > 1:600833/1‑251 (MQ=255) aTGTTACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATCGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGCACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTGCCGCCGATTGAAATGGCGTACTGACCGATTCCCGACACTTCTaaaa > 1:39588/1‑251 (MQ=255) | TGTTTCTTTTGTCTGTCCGCCTGACCTTTTTTCTGTTGTTGAATTCGCCCCCATTCCTGCGCTGCCGAGCCCGTATCAACCATCACGGCGCCGATAACTTCACCGTTATCGCCTTCACCGCCGCCCATAATGTCAATATTATGGTAGAGCGAGCTTAAAATTAACAATCCGAACAACGCTAAGTGCATTATGATGGAAATCACAACTGCATCAACATCACCTTTTTGTCGCTTATTCTGCACAATGTCACCTATTTAATTAAATTGGGTTTGTCATTAAACCAACGGATTTGATGCCGGCAAGATGAAGCAAATTGAGTGCTTTAATGACCTCTTCATAAGGTACTTCTTTGGCACCGCCGACTAAGAACATTGTATTGTTATCTTTATCAAATTCTTGTTTTGATAGTTGGGTAACCATCTCTTCGGTAAGATTTTCCGTACGGGTGCCGCCGATTGAAATGGCGTACTGACCGATTCCCGACACTTCTAAAA > 1/1995690‑1996183 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |