| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,976,555 | T→C | intergenic (+42049/+15874) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,976,555 | 0 | T | C | 100.0% | 242.8 / NA | 84 | intergenic (+42049/+15874) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (29/55); total (29/55) | |||||||||||
TAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTAAAACTCGCAGCAACATAACTCGCCAACTGTTTATCCCAAATGTTAGTCATTTGAGGAGAAATAGCCATCGCTTTAATTGTATTAATGGCAGTCACTGATTCAACAAGAAAAGACTGATTGTCGGCATTTCTTGCGAACTTATCATCAAGCCGTTTCCTAAGAATAGGACTAATAAAAACAGACCAAATGACATAACAAGGTAAAGAACCGAGTACAACTAATGTTAATTTTGGGCTGTAATACCACATAACGGCGAAGAAAATAAAAGAGAATAACAAGTCTAAAATAGAGGTAAGTGCCTGCCCTGTTAAGAAATTCCGAATTTGATCTAATTCACGAACACGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAA > 1/1976308‑1976793 | tAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTAAAACTCGCAGCAACATAACTCGCCAACTGTTTATCCCAAATGTTAGTCATTTGAGGAGAAATAGCCATCGCTTTAATTGTATTAATGGCAGTCACTGATTCAACAAGAAAAGACTGATTGTCGGCATTTCTTGCGAACTTATCATCAAGCCGTCTcc < 1:629131/251‑1 (MQ=255) 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TAAATGTGCGCCAAGCCATAGATTGATCACCATAACGGCTTTCTGGATAAGTTGGATACCTTGCTGCCCGATCGTTGCAAGCACGGTCACTTTAAAACTCGCAGCAACATAACTCGCCAACTGTTTATCCCAAATGTTAGTCATTTGAGGAGAAATAGCCATCGCTTTAATTGTATTAATGGCAGTCACTGATTCAACAAGAAAAGACTGATTGTCGGCATTTCTTGCGAACTTATCATCAAGCCGTTTCCTAAGAATAGGACTAATAAAAACAGACCAAATGACATAACAAGGTAAAGAACCGAGTACAACTAATGTTAATTTTGGGCTGTAATACCACATAACGGCGAAGAAAATAAAAGAGAATAACAAGTCTAAAATAGAGGTAAGTGCCTGCCCTGTTAAGAAATTCCGAATTTGATCTAATTCACGAACACGAGCCACCGTATCCCCAACCCGACGAGCTTCAAAATAAGAAATCGGTAA > 1/1976308‑1976793 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |