| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,973,735 | A→G | intergenic (+39229/+18694) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,973,735 | 0 | A | G | 100.0% | 114.6 / NA | 42 | intergenic (+39229/+18694) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/tRNA‑Lys‑CTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (16/26); total (16/26) | |||||||||||
CTTTTGCACTTGCTGATAACATAATTGTCTCCGTCACAGGTTTAAAGTGCGGTCAAAATAGCACAAGAAAATTTTTGTCAAAAACTTTTTTCGGAAAAAATGTGAACTACATCACAATATTTTTTAACCAAAAATTTTTAAAACGTGATACAGATCACAGTTTTTAATTCAAGGAGACAATTATGTGATTTAGATCACATTTTAATCCCAATAAAGTAGGATAAAAAAACACCAGGGAAATCCACCGCACTTTTGCACCAGAAAACTACAACGGGCTTTCGGCTTGCTGGTATTCGCAAATGCAGGTAATACGATTTCAATTATAAATCCATCATCAAGTTACCGTTTTATACTGTCTAACCAAATCCATTTTCAATTTAGACTTTTGATACATTGCGGAAAATCAGAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGT > 1/1973502‑1973981 | cTTTTGCACTTGCTGATAACATAATTGTCTCCGTCACAGGTTTAAAGTGCGGTCAAAATAGCACAAGAAAATTTTTGTCAAAAACTTTTTTCGGAAAAAATGTGAACTACATCACAATATTTTTTAACCAAAAATTTTTAAAACGTGATACAGATCACAGTTTTTAATTCAAGGAGACAATTATGTGATTTAGATCACATTTTAATCCCAATAAAGTAGGATAAAAAAACACCGGGGAAATCCACCGCa > 1:789161/1‑249 (MQ=255) 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1:48206/239‑1 (MQ=255) gTTTTTAATTCAAGGAGACAATTATGTGATTTAGATCACATTTTAATCCCAATAAAGTAGGATAAAAAAACACCGGGGAAATCCACCGCACTTTTGCACCAGAAAACTACAACGGGCTTTCGGCTTGCTGGTATTCGCAAATGCAGGTAATACGATTTCAATTATAAATCCATCATCAAGTTACCGTTTTATACTGTCTAACCa < 1:443911/204‑1 (MQ=255) gTTTTTAATTCAAGGAGACAATTATGTGATTTAGATCACATTTTAATCCCAATAAAGTAGGATAAAAAAACACCGGGGAAATCCACCGCACTTTTGCACCAGAAAACTACAACGGGCTTTCGGCTTGCTGGTATTCGCAAATGCAGGTAATACGATTTCAATTATAAATCCATCATCAAGTTACCGTTTTATACTGTCTAACCa > 1:423032/1‑204 (MQ=255) gTTTTTAATTCAAGGAGACAATTATGTGATTTAGATCACATTTTAATCCCAATAAAGTAGGATAAAAAAACACCGGGGAAATCCACCGCACTTTTGCACCAGAAAACTACAACGGGCTTTCGGCTTGCTGGTATTCGCAAATGCAGGTAATACGATTTCAATTATAAATCCATCATCAAGTTACCGTTTTATACTGTCTAACCAAATCCATTTTCAATTTAGACTTTTGATACATTGCGGAAAATCAGAAt > 1:188272/1‑251 (MQ=255) 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CTTTTGCACTTGCTGATAACATAATTGTCTCCGTCACAGGTTTAAAGTGCGGTCAAAATAGCACAAGAAAATTTTTGTCAAAAACTTTTTTCGGAAAAAATGTGAACTACATCACAATATTTTTTAACCAAAAATTTTTAAAACGTGATACAGATCACAGTTTTTAATTCAAGGAGACAATTATGTGATTTAGATCACATTTTAATCCCAATAAAGTAGGATAAAAAAACACCAGGGAAATCCACCGCACTTTTGCACCAGAAAACTACAACGGGCTTTCGGCTTGCTGGTATTCGCAAATGCAGGTAATACGATTTCAATTATAAATCCATCATCAAGTTACCGTTTTATACTGTCTAACCAAATCCATTTTCAATTTAGACTTTTGATACATTGCGGAAAATCAGAATGTTATATTCTATCTTTTATAATTAACGTTCTCTTAAACTTTTATCAATAGATTCTTCTAATGGGCTGAGT > 1/1973502‑1973981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |