| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,934,477 | G→T | noncoding (48/77 nt) | unknown → | tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,934,477 | 0 | G | T | 100.0% | 229.5 / NA | 82 | noncoding (48/77 nt) | unknown | tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (45/37); total (45/37) | |||||||||||
CATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGAAAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGGCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAGTAGAAAGGGGAAACATTATGGCAATACATCAAAT > 1/1934232‑1934705 | cATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCggg < 1:469631/251‑1 (MQ=255) ataaAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGa > 1:869040/1‑251 (MQ=255) aTCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTcc > 1:259112/1‑250 (MQ=255) ccGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAG‑AAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGtt > 1:476212/1‑250 (MQ=255) 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tatgcTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATTCCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATc < 1:156384/247‑1 (MQ=255) aTTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATc < 1:777933/145‑1 (MQ=255) aTTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATtatctatc > 1:554052/1‑185 (MQ=255) aTTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGaa > 1:5031/1‑204 (MQ=255) aTTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGccgatttgg > 1:196215/1‑244 (MQ=255) aTTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTAACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGGTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGaa > 1:455680/1‑204 (MQ=255) ttCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTaaa < 1:695571/224‑1 (MQ=255) ttCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAg > 1:666118/1‑251 (MQ=255) aaTTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATc < 1:65500/140‑1 (MQ=255) aTTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTc > 1:120619/1‑134 (MQ=255) gTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCTCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACtat > 1:228723/1‑161 (MQ=255) gTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAGTAGAAAGGGGAAACa > 1:194784/1‑251 (MQ=255) ttCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAGTAGAAAGGGGAAACAtt < 1:181390/249‑1 (MQ=255) ggTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAGTAGAAAGGGGAAACATTATGGc < 1:868422/247‑1 (MQ=255) gTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAg > 1:123878/1‑140 (MQ=255) ttAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAGTAGAAAGGGGAAACATTATGGCAATAc < 1:281738/250‑1 (MQ=255) gAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCttt < 1:483346/129‑1 (MQ=255) tACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAGTAGAAAGGGGAAACATTATGGCAATACATCAAAt < 1:377102/251‑1 (MQ=255) gTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTaa > 1:41085/1‑122 (MQ=255) gTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTaa > 1:72271/1‑122 (MQ=255) gTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACta > 1:669259/1‑132 (MQ=255) gTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACt < 1:135689/131‑1 (MQ=255) | CATTAATAAAATCGTTCACCGATTAAACAAGTAACCCCAAAAGAGAAAAAAAAAGTTGACGGAGTGTCCCTGCGCCATTATTATGCACCTCACCTGTGCGGAGTGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCAATTGTTTTATCTATTCTAATTCGGAGCGGTAGTTCAGCTGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGGCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCAATTTCTCTAAACTAAACGTTCACATTATTTTATCGCCTAAAATTTTATAATTCACATCCACGCCGACCTTCTTTATTAAAGATTTACTATTATCTATCCGTCCAAATAACGCAAGAATACCTTTAAAAAATTTTTAAAAGTATTATTATAAGACGCCAGAATCAGTAGAAAGGGGAAACATTATGGCAATACATCAAAT > 1/1934232‑1934705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |