| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,895,981 | G→A | intergenic (+101054/‑38350) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,895,981 | 0 | G | A | 100.0% | 224.7 / NA | 82 | intergenic (+101054/‑38350) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (41/41); total (41/41) | |||||||||||
ACCAGCCGCTGGAGTTTAAAACGCTGTTCGATTATCGCCATCTCTATTTTAATCCTGATGCCTTTCGCTTTAACTTACCCGCTTTTAAGCATAGATTTATTAGGCGAAAAAATTGACGCCTCGGTCTGGCTGGGCGTGTGGAAAATGGCGACACAAGGTTTTTCTTACACTGCATTTTTAGTGTTTCTTTGCGCCGTGTTTATGCCCATTGCCTTTGCGCTGCTGGTTATTCTGCTGCGGCTGTCACGGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAGTGTGGAACGATTTTTACCCGCAAAGCAAAGCGGTCA > 1/1895734‑1896226 | cccaGCCGCTGGAGTTTAAAACGCTGTTCGATTATCGCCATCTCTATTTTAATCCTGATGCCTTTCGCTTTAACTTACCCGCTTTTAAGCATAGATTTATTAGGCGAAAAAATTGACGCCTCGGTCTGGCTGGGCGTGTGGAAAATGGCGACACAAGGTTTTTCTTACACTGCATTTTTAGTGTTTCTTTGCGCCGTGTTTATGCCCATTGCCTTTGCGCTGCTGGTTATTCTGCTGCGGCTGTCACAGAt < 1:585698/250‑1 (MQ=255) 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1:105551/242‑1 (MQ=255) gCCCATTGCCTTTGCGCTGCTGGTTATTCTGCTGCGGCTGTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCcgacg > 1:656218/1‑251 (MQ=255) ggTTATTCTGCTGCGGCTGTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAGTGTGGAACGATTTTTAc > 1:714562/1‑250 (MQ=255) ttATTCTGCTGCGGCTGTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAGTGTGGAACGATTTTTACCCg > 1:193143/1‑251 (MQ=255) aTTCTGCTGCGGCTGTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAGTGTGGAACGATTTTTACCCgca > 1:875455/1‑251 (MQ=255) ggCTGTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGGACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAGTGTGGAACGATTTTTACCCGCAAAGCAAAGCg > 1:835067/1‑251 (MQ=255) ggCTGTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAAc < 1:680178/141‑1 (MQ=255) ggCTGTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTAttt < 1:370782/168‑1 (MQ=255) gTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACg < 1:754529/77‑1 (MQ=255) gTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAgtg > 1:664034/1‑217 (MQ=255) gTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAgtg > 1:799352/1‑217 (MQ=255) gTCACAGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAGTGTGGAACGATTTTTACCCGCAAAGCAAAGCGGTCa > 1:532199/1‑251 (MQ=255) 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ACCAGCCGCTGGAGTTTAAAACGCTGTTCGATTATCGCCATCTCTATTTTAATCCTGATGCCTTTCGCTTTAACTTACCCGCTTTTAAGCATAGATTTATTAGGCGAAAAAATTGACGCCTCGGTCTGGCTGGGCGTGTGGAAAATGGCGACACAAGGTTTTTCTTACACTGCATTTTTAGTGTTTCTTTGCGCCGTGTTTATGCCCATTGCCTTTGCGCTGCTGGTTATTCTGCTGCGGCTGTCACGGATCATGCACATAAAACCACGCAATTTGTTGATTTCCCTCAGTTATATTAAACCCTGGGTGATGTTTGACGTGTATTTGGTGGCATTGGGCGTGAGCATTTTCAAAGTGCAGGAGTACGCCACATTAGAACTGAATATTTACTTAATCGCTTTTATTTTTACCGCACTTTTAACCACGCTCTTGTTTATTAAAATTAACCCCGACGAAGTGTGGAACGATTTTTACCCGCAAAGCAAAGCGGTCA > 1/1895734‑1896226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |