| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,840,809 | C→T | intergenic (+45882/‑93522) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,840,809 | 0 | C | T | 100.0% | 127.5 / NA | 47 | intergenic (+45882/‑93522) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (23/24); total (23/24) | |||||||||||
AATTTAATATCTCTATAAATTAGTTGTTTAAATAGCTCTCTGTAGGAAAAAAAATTATTTGTTTTATCTAATAAGAATTTAATCATACTAATTAATCTATGCTAAGAGTAATTTACTAATTAAAATTTTACCGTTTCTGCCAATACTTTACCTGCTAAGTCCTTAGCCGATAAACTCGGTTCACCATAAAGCGGCCATTCAATACCAATCGTTTCATCATTCCAAATCAGTGAATGTTCGGCCTTTGGATTGTAGTAATCCGTACATTTATAAGTAAATTCAGCTTCATCTGTCAACACATAAAAACCGTGAGCAAAACCTTCCGGCACCCATAGTTGGTGCTTATTCTCGGCAGATAAGATTTCACCTACCCATTGCCCAAAAGTTAACGAGTTTCCACGCATATCCACAGCCACATCAAATACCGCACCAGAAATAACACGAACTAATTTGCCTTGTGTATTTTCTGTTTGATAATGTAAAC > 1/1840567‑1841050 | aatttaatATCTCTATAAATTAGTTGTTTAAATAGCTCTCTGTAGGAAAAAAAATTATTTGTTTTATCTAATAAGAATTTAATCATACTAATTAATCTATGCTAAGAGTAATTTACTAATTAAAATTTTACCGTTTCTGCCAATACTTTACCTGCTAAGTCCTTAGCCGATAAACTCGGTTCACCATAAAGCGGCCATTCAATACCAATCGTTTCATCATTCCAAATCAGTGAATGTTCGGCTTTTGGAtt > 1:366107/1‑251 (MQ=255) 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AATTTAATATCTCTATAAATTAGTTGTTTAAATAGCTCTCTGTAGGAAAAAAAATTATTTGTTTTATCTAATAAGAATTTAATCATACTAATTAATCTATGCTAAGAGTAATTTACTAATTAAAATTTTACCGTTTCTGCCAATACTTTACCTGCTAAGTCCTTAGCCGATAAACTCGGTTCACCATAAAGCGGCCATTCAATACCAATCGTTTCATCATTCCAAATCAGTGAATGTTCGGCCTTTGGATTGTAGTAATCCGTACATTTATAAGTAAATTCAGCTTCATCTGTCAACACATAAAAACCGTGAGCAAAACCTTCCGGCACCCATAGTTGGTGCTTATTCTCGGCAGATAAGATTTCACCTACCCATTGCCCAAAAGTTAACGAGTTTCCACGCATATCCACAGCCACATCAAATACCGCACCAGAAATAACACGAACTAATTTGCCTTGTGTATTTTCTGTTTGATAATGTAAAC > 1/1840567‑1841050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |