| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,837,782 | A→G | intergenic (+42855/‑96549) | unknown → / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,837,782 | 0 | A | G | 100.0% | 74.8 / NA | 27 | intergenic (+42855/‑96549) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (12/15); total (12/15) | |||||||||||
AAAAGAATAAACACTTCCTAAGGCAGTAAAATATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAAAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAACCTATCCCAAAATCAGGAATAAACCAAATTATTTTAGGAGAGCTTATATTAATTGATTGTTTTAATTTAGGTGGGTTTGCTGAATAATTA > 1/1837587‑1838007 | aaaaGAATAAACACTTCCTAAGGCAGTAAAATATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAAc < 1:229391/251‑1 (MQ=255) tAAACACTTCCTAAGGCAGTAAAATATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATAc < 1:34799/251‑1 (MQ=255) ccTAAGGCAGTAAAATATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATc < 1:21204/251‑1 (MQ=255) gCAGTAAAATATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGt < 1:861251/239‑1 (MQ=255) gTAAAATATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCtt > 1:477416/1‑193 (MQ=255) aaaaTATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAatat > 1:118012/1‑251 (MQ=255) gTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATc > 1:604464/1‑232 (MQ=255) tCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCtgaat < 1:237614/235‑1 (MQ=255) aaGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGt > 1:12680/1‑209 (MQ=255) aaGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCAt > 1:517808/1‑251 (MQ=255) ttCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATAc < 1:201816/197‑1 (MQ=255) ttCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTaa > 1:142108/1‑202 (MQ=255) tCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAg > 1:803332/1‑248 (MQ=255) ttattaAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAg < 1:377040/237‑1 (MQ=255) ttatttaCATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAAcc < 1:755922/251‑1 (MQ=255) tatttaCATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAAc < 1:157868/249‑1 (MQ=255) atttaCATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAAc < 1:13734/248‑1 (MQ=255) aCATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCtt > 1:123466/1‑130 (MQ=255) aCATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAatat < 1:375223/178‑1 (MQ=255) atatGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATc > 1:20901/1‑130 (MQ=255) gTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAACCTATCCCAAAATCAGGAAt > 1:764324/1‑251 (MQ=255) atCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGa > 1:304707/1‑123 (MQ=255) atCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATAc < 1:644134/132‑1 (MQ=255) aaaTCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCtt < 1:809914/70‑1 (MQ=255) gagTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAg > 1:141510/1‑106 (MQ=255) agTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAACCTATCCCAAAATCAGGAATAAACCAAATTATTTTAGGAGAGCTTATATTAATTGATTGTTTTAATTTAGGTg < 1:146932/249‑1 (MQ=255) tAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAGAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACTACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAACCTATCCCAAAATCAGGAATAAACCAAATTATTTTAGGAGAGCTTATATTAATTGATTGTTTTAATTTAGGTGGGTTTGCTGAAtaatta < 1:428894/251‑1 (MQ=255) | AAAAGAATAAACACTTCCTAAGGCAGTAAAATATGGTTCGTAATCTTGCACAAAGTATGCTTTCTTATAGCAATTATTAAATTTATTTACATAATATGCTGTTTGCCAAGAAGTCGCCATAGCAATATCATAGCTTGTTAATTGTTCAAAATCAGAGTCATCTTCTAGAATAAAAATTCTAGAATTCAAAGGAAAAAAATGTTTCGATAGTATGTCTTTGATCACTTCCTCTGTTCCCCACTGGCTAGAACCACATACAGTAATATCTGAATGAATATCTAATTTTTCTAAATTATAAATCATTCTAAAGATATTAAGGTGCCCTCCAGAACCTATCCCAAAATCAGGAATAAACCAAATTATTTTAGGAGAGCTTATATTAATTGATTGTTTTAATTTAGGTGGGTTTGCTGAATAATTA > 1/1837587‑1838007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |