| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 359,746 | G→A | intergenic (‑14823/+52130) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | 1 | 359,746 | 0 | G | A | 99.0% | 272.8 / NA | 103 | intergenic (‑14823/+52130) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (44/58); total (44/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GATGCCACCGGGCGTGAAGTGGCACCGCCGATTCGCACCGGTTATCCGGAAGATAAAGTGCGGTTGATTGACGTGTTACTTCGTCCGGAAGTGTTGGTGTATGAGCCTTTATGGACGGCAATTCCAAGCAATAAAGCGATTTTGCCGGTGTTGTGGTCGTTGTTCCCGAATCACCGTTA‑TTTGCTGGAAGCCGGTTTTGAACTTACGCCGAAACTCATTGCCAACGGTTATGCGCAAAAACCTATTGCCGGTCGCCGTGGCGATAACGTAAAACTTATCGGCGAGTGCAAAACCGTCTTGGATAGCACCAACGGGTGTTTTGCTAAACAAGAAAATATCTACCAGCAATTATGGTGCTTGCCGAAAGTGGAAGATCAATATGTGCAGGTGTGTACGTTTACCGTAGGCGGGCATTATGCCGGCAGTTGTTTGCGCTCCGACCCGACCCGCGTGATTGTGGGCGACAGCGATATGCAACCGTTGCGAATATT > 1/359500‑359990 | gATGCCACCGGGCGTGAAGTGGCACCGCCGATTCGCACCGGTTATCCGGAAGATAAAGTGCGGTTGATTGACGTGTTACTTCGTCCGGAAGTGTTGGTGTATGAGCCTTTATGGACGGCAATTCCAAGCAATAAAGCGATTTTGCCGGTGTTGTGGTCGTTGTTCCCGAATCACCGTTA‑TTTGCTGGAAGCCGGTTTTGAACTTACGCCGAAACTCATTGCCAACGGTTATGCGCAAAAACCTATTACCgg > 1:399172/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |