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ttGCATCAGCACGGGAAGCTACAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTgg < 1:150824/176‑1 (MQ=255) gCACGGGAAGCTACAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGa < 1:640446/227‑1 (MQ=255) cACGGGAAGCTACAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGAt < 1:88202/251‑1 (MQ=255) cACGGGAAGCTACAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGAt < 1:693579/251‑1 (MQ=255) gAAGCTACAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTg < 1:186322/250‑1 (MQ=255) aaGCTACAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTAt > 1:332061/1‑138 (MQ=255) cAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAg < 1:715672/139‑1 (MQ=255) tttCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTGTCAtaatt < 1:345809/248‑1 (MQ=255) ttCACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTGTCATAATTAATc < 1:870279/251‑1 (MQ=255) cACCGAAACCGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTGTCATAATTAATCtt > 1:781137/1‑251 (MQ=255) ccGTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTGTCATAATTAATCTTCAATTTTa > 1:24298/1‑251 (MQ=255) gTCATCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTGTCATAATTAATCTTCAATTTTAAg > 1:798350/1‑251 (MQ=255) aTCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTgg > 1:704477/1‑136 (MQ=255) aTCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGt < 1:364113/185‑1 (MQ=255) aTCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCaa > 1:843213/1‑215 (MQ=255) aTCCACCACTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTGTCATAATTAATCTTCAATTTTAAGTaa > 1:247550/1‑251 (MQ=255) | TACTTTGAATTCTAATTCTTTGCCAAGTAAGTGATCTGCATCACGAACAGGACGGGTATCAACCAATGAACCCGGTAAGAATGCGCGAACACCGCTTAACTCAACTGTGAAGCCACCTTTAACTTTACCGTTAACCAAACCAAGAACAGTCGCTTGTTCGTCGTATGCTTTTTCCAATACAATCCAAGCTTCGTTGCGTTTTGCATCAGCACGGGAAGCTACAGTTTCACCGAAACCGTCATCCACCGCTTTAAGCACGACATCAACAACATCACCCACTTGAACTTCCAATTCACCTTGTGCATTAAAAAATTCTTCGGCAGGAATAGCTGATTCGGATTTAGATCCAGTATCTACAAGTACGAAGCCTTTTTGGATAGCAACGATGGTACCTTTAACGACCGCACCTTGACGGGTTTCAAGGTCTTTCAATGATTCTTCAAAGAGTTGAGCAAAAGATTCTGTCATAATTAATCTTCAATTTTAAGTAA > 1/1758145‑1758635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |